RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	TNS2	Q63HR2	1409 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	KIF3A	Q9Y496	699 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	TOM1	O60784	492 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	MEIS3	Q99687	375 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	FBLN1	P23142	703 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	CIAO1	O76071	339 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	SRGAP3	O43295	1099 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	USP44	Q9H0E7	712 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	MEGF6	O75095	1541 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	EXOC5	O00471	708 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	ADCY9	O60503	1353 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	MSH5	O43196	834 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	LGR6	Q9HBX8	967 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	DISP2	A7MBM2	1401 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	GCKR	Q14397	625 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	PHF14	O94880	888 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	SDS	P20132	328 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	G2E3	Q7L622	706 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	PDC	P20941	246 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	RGPD5	Q99666	1765 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	MBD3	O95983	291 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	ATP5J	P18859	108 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667		F6X3S4	739 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	CHML	P26374	656 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RBM23-233	ENST00000557667	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	10.22	□□□□□ -0.77

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