RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-214ENST00000548849 MCM10Q7L590 875 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-214ENST00000548849 POTECB2RU33 542 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 STYK1Q6J9G0 422 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 MASTLQ96GX5 879 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 SRGNP10124 158 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 PPP2R1AP30153 589 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 DCTN1Q14203 1278 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 SOGA3Q5TF21 947 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 BCORQ6W2J9 1755 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 CACNA1SQ13698 1873 aa22.66■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 SLX4Q8IY92 1834 aa22.66■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CS-214ENST00000548849 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 FAM177BA6PVY3 158 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 NBPF26B4DH59 902 aa22.62■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 NBPF15Q8N660 670 aa22.62■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 NPR1P16066 1061 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 CCDC93Q567U6 631 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 CHADLQ6NUI6 762 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 PCNTO95613 3336 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 POTEIP0CG38 1075 aa22.58■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 POTEJP0CG39 1038 aa22.58■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CS-214ENST00000548849 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 RGL2O15211 777 aa22.57■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 NEFMP07197 916 aa22.57■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 HLFQ16534 295 aa22.57■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 TNS4Q8IZW8 715 aa22.57■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 NGEFQ8N5V2 710 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 OLFM4Q6UX06 510 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 CREBZFQ9NS37 354 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 CAPN15O75808 1086 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 ALDH1B1P30837 517 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 LDHDQ86WU2 507 aa22.52■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CS-214ENST00000548849 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 SYNE4Q8N205 404 aa22.51■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 NYXQ9GZU5 481 aa22.51■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.51■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 SCN4AP35499 1836 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 MYL6BP14649 208 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 HACL1Q9UJ83 578 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 GPTP24298 496 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 NFE2L2Q16236 605 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 PASKQ96RG2 1323 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 ABCC12Q96J65 1359 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 FZD9O00144 591 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 EPHX2P34913 555 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 CRY2Q49AN0 593 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 NUP98P52948 1817 aa22.45■■□□□ 1.19
CS-214ENST00000548849 JDP2Q8WYK2 163 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-214ENST00000548849 PSMD1Q99460 953 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-214ENST00000548849 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CS-214ENST00000548849 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-214ENST00000548849 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-214ENST00000548849 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CS-214ENST00000548849 CNTNAP1P78357 1384 aa22.44■■□□□ 1.18
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