RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 NFIXQ14938 502 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 PROSER3Q2NL68 480 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 TGFB2P61812 414 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 CHD4Q14839 1912 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 TSPYL6Q8N831 410 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 HYPKQ9NX55 129 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 LAMB2P55268 1798 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 E9PSI1 815 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 VAMP4O75379 141 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 SERPINB2P05120 415 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 MYL6BP14649 208 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 GOLGA2Q08379 1002 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 HLFQ16534 295 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 SETDB2Q96T68 719 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ANXA1P04083 346 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 SLFN5Q08AF3 891 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 COPS6Q7L5N1 327 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 KCNA3P22001 575 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 PARP10Q53GL7 1025 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 CNBD1Q8NA66 436 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 NECTIN2Q92692 538 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ZNF428Q96B54 188 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ADCY9O60503 1353 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ABCC12Q96J65 1359 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 NTSR2O95665 410 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 TCIRG1Q13488 830 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 NYXQ9GZU5 481 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 UTRNP46939 3433 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 DPEP1P16444 411 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.194e-10■■□□□ 14.3
CS-213ENST00000548746 PDE6BP35913 854 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 ST5P78524 1137 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 CRY2Q49AN0 593 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-213ENST00000548746 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.6□□□□□ -1.19
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