RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-211ENST00000548041 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-211ENST00000548041 CHD4Q14839 1912 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
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CS-211ENST00000548041 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.18□□□□□ -0.62
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CS-211ENST00000548041 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.17□□□□□ -0.62
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CS-211ENST00000548041 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.17□□□□□ -0.62
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CS-211ENST00000548041 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.16□□□□□ -0.62
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CS-211ENST00000548041 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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CS-211ENST00000548041 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 ATP10DQ9P241 1426 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 TAF1P21675 1872 aa11.15□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.15□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 SERPINB2P05120 415 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 COPS6Q7L5N1 327 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 GOLGA2Q08379 1002 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 SPEF2Q9C093 1822 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 SLX4Q8IY92 1834 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 FAM177BA6PVY3 158 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 SETDB2Q96T68 719 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 E9PSI1 815 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 VAMP4O75379 141 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 GPTP24298 496 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 SLFN5Q08AF3 891 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 ZNF428Q96B54 188 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 HYPKQ9NX55 129 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 ABCC12Q96J65 1359 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 SBF1O95248 1867 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 RGL2O15211 777 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 G2E3Q7L622 706 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 A0A0G2JLW4 131 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 DPEP1P16444 411 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.635e-10■□□□□ 9.3
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CS-211ENST00000548041 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 CNBD1Q8NA66 436 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-211ENST00000548041 ADCY9O60503 1353 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 NPHP1O15259 732 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 KCNA3P22001 575 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 TGFB2P61812 414 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 SUSD4Q5VX71 490 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 STK31Q9BXU1 1019 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 COL4A1P02462 1669 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 NTSR2O95665 410 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 SLC4A2P04920 1241 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 ST5P78524 1137 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 FLIIQ13045 1269 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 TCIRG1Q13488 830 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 GPR162Q16538 588 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 ERFEQ4G0M1 354 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-211ENST00000548041 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.06□□□□□ -0.64
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