RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 TMEM94Q12767 1356 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.527e-8■■■□□ 15.6
CS-205ENST00000546891 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 EVI5LQ96CN4 794 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 DCAF5Q96JK2 942 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ZNF445P59923 1031 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 MCTP1Q6DN14 999 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 PLEKHG5O94827 1062 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 BRD1O95696 1058 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ANXA1P04083 346 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 PROSER3Q2NL68 480 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 KLHL34Q8N239 644 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 PALD1Q9ULE6 856 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 MEGF6O75095 1541 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 COL18A1P39060 1754 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 AACSQ86V21 672 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 TICAM2Q86XR7 235 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 KCNB2Q92953 911 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 SUCLG2Q96I99 432 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 AK9Q5TCS8 1911 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 PHF14O94880 888 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 PDIA6Q15084 440 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 RNF20Q5VTR2 975 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 SNRKQ9NRH2 765 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.77□□□□□ -0.52
CS-205ENST00000546891 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 PSMA5P28066 241 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 CABP4P57796 275 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 GCKRQ14397 625 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 VPS53Q5VIR6 699 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 COPRSQ9NQ92 184 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 C5P01031 1676 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 TTC14Q96N46 770 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 ARXQ96QS3 562 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 RGPD5Q99666 1765 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 IGKV5-2P06315 115 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 ANKRD1Q15327 319 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 COPS6Q7L5N1 327 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 MYD88Q99836 296 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 PANK2Q9BZ23 570 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-205ENST00000546891 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms