RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	PROSER3	Q2NL68	480 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	ANXA1	P04083	346 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	TM4SF1	P30408	202 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	NFIX	Q14938	502 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	VAMP4	O75379	141 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	DDR1	Q08345	913 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.78	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	SERPINB2	P05120	415 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	HLF	Q16534	295 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PUF60-222	ENST00000533362	NUP98	P52948	1817 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	SLC4A2	P04920	1241 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	NPHP1	O15259	732 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	CNBD1	Q8NA66	436 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	ST5	P78524	1137 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PUF60-222	ENST00000533362	FLII	Q13045	1269 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	TGFB2	P61812	414 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	GPT	P24298	496 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	KSR2	Q6VAB6	950 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	G2E3	Q7L622	706 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PUF60-222	ENST00000533362	PDE6B	P35913	854 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	ADCY9	O60503	1353 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	MYD88	Q99836	296 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	PTPRC	P08575	1304 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	NTSR2	O95665	410 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PUF60-222	ENST00000533362	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PUF60-222	ENST00000533362		H0YIN7	160 aa		28.57	■■■□□ 2.16

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