RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528187.5

SLC43A3-210, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC43A3, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-210ENST00000528187 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC43A3-210ENST00000528187 BCORQ6W2J9 1755 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC43A3-210ENST00000528187 HTRA3P83110 453 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC43A3-210ENST00000528187 STYK1Q6J9G0 422 aa22.71■■□□□ 1.23
SLC43A3-210ENST00000528187 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SLC43A3-210ENST00000528187 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 CNKSR1Q969H4 720 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 HLFQ16534 295 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 MASTLQ96GX5 879 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 RGL2O15211 777 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 NEFMP07197 916 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 NFE2L2Q16236 605 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 POTECB2RU33 542 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 FAM177BA6PVY3 158 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 ERFEQ4G0M1 354 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 IFFO2Q5TF58 517 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 NGEFQ8N5V2 710 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 SLX4Q8IY92 1834 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC43A3-210ENST00000528187 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 WDR90Q96KV7 1748 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 NPR1P16066 1061 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 KLRG1Q96E93 195 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 SOGA3Q5TF21 947 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 OLFM4Q6UX06 510 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 CCDC93Q567U6 631 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 MYL6BP14649 208 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 ABCC12Q96J65 1359 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.58■■□□□ 1.21
SLC43A3-210ENST00000528187 RALBP1Q15311 655 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 JMYQ8N9B5 988 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 RIPK4P57078 832 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 GPTP24298 496 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 POTEIP0CG38 1075 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 POTEJP0CG39 1038 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 CRY2Q49AN0 593 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 NYXQ9GZU5 481 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 CACNA1SQ13698 1873 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 ALDH1B1P30837 517 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 PDIA6Q15084 440 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 SUSD4Q5VX71 490 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 ERBB4Q15303 1308 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3-210ENST00000528187 PCNTO95613 3336 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 PROSER3Q2NL68 480 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 SNED1Q8TER0 1413 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 NTSR2O95665 410 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 ANXA1P04083 346 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 CHADLQ6NUI6 762 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 SLC51AQ86UW1 340 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 SYNE4Q8N205 404 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3-210ENST00000528187 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.2 ms