RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516902.1

RN7SKP116-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 116, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP116, Length 319 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP116-201ENST00000516902 A6NJR5 290 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 PIK3CDO00329 1044 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 EML1O00423 815 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 SIN3BO75182 1162 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 SKIP12755 728 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 NOS2P35228 1153 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 TXLNAP40222 546 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 GTF2IP78347 998 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 MCM6Q14566 821 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 SYT9Q86SS6 491 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 STRN4Q9NRL3 753 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 GATA4P43694 442 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 ALG2Q9H553 416 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 ZNF358Q9NW07 568 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP116-201ENST00000516902 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 EPHA4P54764 986 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 PSME1Q06323 249 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 NCOA4Q13772 614 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 DOC2BQ14184 412 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 WWC1Q8IX03 1113 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 MDFIQ99750 246 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 TNFRSF25Q93038 417 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 COG6Q9Y2V7 657 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 TRIM50Q86XT4 487 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 SERTM1A2A2V5 107 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 ITGB7P26010 798 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 NEUROD1Q13562 356 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 USP17L5A8MUK1 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 M0R082 166 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 APBA3O96018 575 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 ATP1A2P50993 1020 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 TNS4Q8IZW8 715 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 NACC1Q96RE7 527 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 POTEAQ6S8J7 498 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 SLC30A3Q99726 388 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 KCNQ4P56696 695 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 SPEM2Q0P670 501 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 TBCELQ5QJ74 424 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP116-201ENST00000516902 M0R2N6 131 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 CCDC102BQ68D86 513 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 BRD7Q9NPI1 651 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 ALBP02768 609 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 NID1P14543 1247 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 ADH7P40394 386 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 CEP63Q96MT8 703 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 EFCC1Q9HA90 598 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 RAD21O60216 631 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 USP17L3A6NCW0 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 USP17L4A6NCW7 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 SFI1A8K8P3 1242 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 C9orf172C9J069 976 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 LILRB5O75023 590 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 CLDN10P78369 228 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 TYRO3Q06418 890 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 HIF1AQ16665 826 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP116-201ENST00000516902 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms