RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496230.5

HCN3-204, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

TSL 2

Gene HCN3, Length 3,245 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-204ENST00000496230 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN3-204ENST00000496230 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HCN3-204ENST00000496230 PPFIA3O75145 1194 aa14.58□□□□□ -0.07
HCN3-204ENST00000496230 KCNJ4P48050 445 aa14.58□□□□□ -0.07
HCN3-204ENST00000496230 KAZALD1Q96I82 304 aa14.58□□□□□ -0.07
HCN3-204ENST00000496230 DCAF5Q96JK2 942 aa14.58□□□□□ -0.07
HCN3-204ENST00000496230 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.58□□□□□ -0.07
HCN3-204ENST00000496230 CHMLP26374 656 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.57□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 FAM182BQ5T319 152 aa14.57□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.57□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.57□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 REC8O95072 547 aa14.57□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.57□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 NBPF26B4DH59 902 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 IL2RBP14784 551 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 NBPF14Q5TI25 921 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 NBPF15Q8N660 670 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 LINS1Q8NG48 757 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 MCM4P33991 863 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 AK9Q5TCS8 1911 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 GCKRQ14397 625 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 UTRNP46939 3433 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 FAM89AQ96GI7 184 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 FAM227BQ96M60 508 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 EP400Q96L91 3159 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 SASH1O94885 1247 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 TIMM10P62072 90 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 MCTP1Q6DN14 999 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 TFCP2Q12800 502 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 TRAK2O60296 914 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 SNRKQ9NRH2 765 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 ST18O60284 1047 aa14.52□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.52□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 FSD1Q9BTV5 496 aa14.52□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.52□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.52□□□□□ -0.08
HCN3-204ENST00000496230 PTH1RQ03431 593 aa14.52□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.52□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 RASEFQ8IZ41 740 aa14.52□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.52□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 POLA2Q14181 598 aa14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 PIGBQ92521 554 aa14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 RABEP1Q15276 862 aa14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 CNTROBQ8N137 903 aa14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.5□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.5□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 HOXB7P09629 217 aa14.49□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 LRRC24Q50LG9 513 aa14.49□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.49□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 PANK2Q9BZ23 570 aa14.49□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 FOSBP53539 338 aa14.49□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 STK3Q13188 491 aa14.49□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 TMX3Q96JJ7 454 aa14.49□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.49□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 SNAP23O00161 211 aa14.48□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 RAB11FIP3O75154 756 aa14.48□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 ALDH1L1O75891 902 aa14.48□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 MCCP23508 829 aa14.48□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.48□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.48□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.48□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 HLFQ16534 295 aa14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.47□□□□□ -0.09
HCN3-204ENST00000496230 NECAB1Q8N987 351 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms