RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PSMA5P28066 241 aa9.98□□□□□ -0.81
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PTPRD-211ENST00000486161 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-211ENST00000486161 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.98□□□□□ -0.81
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PTPRD-211ENST00000486161 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.98□□□□□ -0.81
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PTPRD-211ENST00000486161 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM29Q14134 588 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-211ENST00000486161 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-211ENST00000486161 CPDO75976 1380 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-211ENST00000486161 PDE8AO60658 829 aa9.91□□□□□ -0.82
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