RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484806.1

SFI1-223, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-223	ENST00000484806	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SFI1-223	ENST00000484806	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SFI1-223	ENST00000484806	C4B	P0C0L5	1744 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SFI1-223	ENST00000484806	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SFI1-223	ENST00000484806	ADCY9	O60503	1353 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	GNAI3	P08754	354 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ITPK1	Q13572	414 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	NBPF15	Q8N660	670 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	COL15A1	P39059	1388 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806		F6X3S4	739 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	BAG6	P46379	1132 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	RGL2	O15211	777 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ILDR2	Q71H61	639 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ARX	Q96QS3	562 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	SCN7A	Q01118	1682 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	NUP98	P52948	1817 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	GNPAT	O15228	680 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	RPS6KA4	O75676	772 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	TXNRD1	Q16881	649 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	MYD88	Q99836	296 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	GNAI2	P04899	355 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	SSFA2	P28290	1259 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	ZPR1	O75312	459 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	HMMR	O75330	724 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-223	ENST00000484806	C4A	P0C0L4	1744 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	GRM8	O00222	908 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	RFC4	P35249	363 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	MEIS3	Q99687	375 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	CAMTA2	O94983	1202 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	KCNQ4	P56696	695 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	GCKR	Q14397	625 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	NARF	Q9UHQ1	456 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	UTY	O14607	1347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	USP44	Q9H0E7	712 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	STK32B	Q9NY57	414 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	MYH3	P11055	1940 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	PHF14	O94880	888 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	HLF	Q16534	295 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-223	ENST00000484806	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		10.05	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms