RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469356.3

SREBF1-208, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, human

TSL 3

Gene SREBF1, Length 1,323 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SREBF1-208	ENST00000469356	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		29.3	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.3	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	FLII	Q13045	1269 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	CAMTA2	O94983	1202 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	CASZ1	Q86V15	1759 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	GYS1	P13807	737 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
SREBF1-208	ENST00000469356	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	KIF16B	Q96L93	1317 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	PTPRC	P08575	1304 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	KSR2	Q6VAB6	950 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	POLD1	P28340	1107 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	G2E3	Q7L622	706 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	SCN7A	Q01118	1682 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	SPON1	Q9HCB6	807 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	NUP98	P52948	1817 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	FKBP8	Q14318	412 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	SETDB2	Q96T68	719 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SREBF1-208	ENST00000469356	HLF	Q16534	295 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	MSL1	Q68DK7	614 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	TCIRG1	Q13488	830 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	29.19	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	PARP10	Q53GL7	1025 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	BCAR3	O75815	825 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	ATP10D	Q9P241	1426 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	TM4SF1	P30408	202 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	MMP10	P09238	476 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	NFIX	Q14938	502 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SREBF1-208	ENST00000469356	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		29.14	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		29.14	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	MYD88	Q99836	296 aa		29.14	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	ADCY9	O60503	1353 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	NPHP1	O15259	732 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	NYX	Q9GZU5	481 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	MS4A1	P11836	297 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	GPT	P24298	496 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	SERPINB2	P05120	415 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	LINS1	Q8NG48	757 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356		F6X3S4	739 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SREBF1-208	ENST00000469356	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	NLRP10	Q86W26	655 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	DDR1	Q08345	913 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	ALDH1L1	O75891	902 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	PTGER2	P43116	358 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	ST5	P78524	1137 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	CNBD1	Q8NA66	436 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SREBF1-208	ENST00000469356	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		29.05	■■■□□ 2.24

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