RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
UBXN4-204ENST00000426921 NFKBIEO00221 500 aa27.53■■■□□ 2
UBXN4-204ENST00000426921 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
UBXN4-204ENST00000426921 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 23e-8■■□□□ 11.4
UBXN4-204ENST00000426921 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.52■■■□□ 2
UBXN4-204ENST00000426921 STYK1Q6J9G0 422 aa27.51■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.5■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
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UBXN4-204ENST00000426921 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
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UBXN4-204ENST00000426921 NPHP1O15259 732 aa27.49■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 CNKSR1Q969H4 720 aa27.48■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.47■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 MASTLQ96GX5 879 aa27.47■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 C21orf2O43822 256 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 HLFQ16534 295 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 SLX4Q8IY92 1834 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 ERBB4Q15303 1308 aa27.45■■□□□ 1.99
UBXN4-204ENST00000426921 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.45■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.45■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.45■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 RIPK4P57078 832 aa27.44■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.44■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.43■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 GLTPD2A6NH11 291 aa27.43■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 APLP1P51693 650 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 SOGA3Q5TF21 947 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 RRAGCQ9HB90 399 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 CACNA1SQ13698 1873 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 NPR1P16066 1061 aa27.41■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 NUP98P52948 1817 aa27.41■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 FSTL1Q12841 308 aa27.4■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.4■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.4■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.39■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.39■■□□□ 1.98
UBXN4-204ENST00000426921 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.39■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.38■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 NGEFQ8N5V2 710 aa27.38■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 MYL6BP14649 208 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 WDR90Q96KV7 1748 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 NYXQ9GZU5 481 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 ABCC12Q96J65 1359 aa27.36■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 FAM177BA6PVY3 158 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 PDIA6Q15084 440 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 CRY2Q49AN0 593 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 ERFEQ4G0M1 354 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 RUNDC1Q96C34 613 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC93Q567U6 631 aa27.34■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.33■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.33■■□□□ 1.97
UBXN4-204ENST00000426921 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.32■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.32■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.32■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.31■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.31■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 SNED1Q8TER0 1413 aa27.31■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 POTECB2RU33 542 aa27.3■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 CHL1O00533 1208 aa27.3■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 ALDH1B1P30837 517 aa27.3■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.3■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 GPTP24298 496 aa27.29■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.29■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 NTSR2O95665 410 aa27.28■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 PROSER3Q2NL68 480 aa27.28■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 SUSD4Q5VX71 490 aa27.28■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 NEUROD2Q15784 382 aa27.27■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 PARP10Q53GL7 1025 aa27.27■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.27■■□□□ 1.96
UBXN4-204ENST00000426921 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 OLFM4Q6UX06 510 aa27.25■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 ANXA1P04083 346 aa27.24■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.24■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.24■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.22■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 HOXB7P09629 217 aa27.22■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 KRT24Q2M2I5 525 aa27.22■■□□□ 1.95
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