RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 NUP98P52948 1817 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC125Q86Z20 511 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 COG6Q9Y2V7 657 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 RPS6KA4O75676 772 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF827Q17R98 1081 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 AK7Q96M32 723 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 ARXQ96QS3 562 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 CRBNQ96SW2 442 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 BCORQ6W2J9 1755 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 MS4A1P11836 297 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 NEFLP07196 543 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 FKBP8Q14318 412 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 AKT1S1Q96B36 256 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 PHF14O94880 888 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 HLFQ16534 295 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 SCN7AQ01118 1682 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 BEND3Q5T5X7 828 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 CAMTA2O94983 1202 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 MYD88Q99836 296 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP10DQ9P241 1426 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 IGKV5-2P06315 115 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5-203ENST00000408919 A0A087WZG4 1122 aa22.58■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 SSFA2P28290 1259 aa22.58■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.58■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 LINS1Q8NG48 757 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 NARFQ9UHQ1 456 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 ADRA2BP18089 450 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 TCIRG1Q13488 830 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 RFC4P35249 363 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC15A2Q16348 729 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 MEIS3Q99687 375 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 GPTP24298 496 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 ZPR1O75312 459 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 ALDH1L1O75891 902 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 USP44Q9H0E7 712 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 STK32BQ9NY57 414 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5-203ENST00000408919 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.52■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 GCKRQ14397 625 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 GYS1P13807 737 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 NLRP10Q86W26 655 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 GRM8O00222 908 aa22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms