RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 PRR5LQ6MZQ0 368 aa35.45■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 C2CD5Q86YS7 1000 aa35.45■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 LAMB4A4D0S4 1761 aa35.45■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CHL1O00533 1208 aa35.44■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 SETDB2Q96T68 719 aa35.43■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 WWC1Q8IX03 1113 aa35.42■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 H0YIN7 160 aa35.4■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 C9orf131Q5VYM1 1079 aa35.4■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP44Q96MT7 982 aa35.4■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF853P0CG23 659 aa35.39■■■■□ 3.26
GNPTAB-202ENST00000392919 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 TTLL6Q8N841 843 aa35.38■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 BRIP1Q9BX63 1249 aa35.38■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 CLEC4GQ6UXB4 293 aa35.37■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 CNBD1Q8NA66 436 aa35.37■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 IFT57Q9NWB7 429 aa35.36■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 NGEFQ8N5V2 710 aa35.35■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 PDE6BP35913 854 aa35.34■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 HLFQ16534 295 aa35.34■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.34■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 SBF1O95248 1867 aa35.34■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 RASSF7Q02833 373 aa35.33■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 MBIPQ9NS73 344 aa35.33■■■■□ 3.25
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF3CO14782 793 aa35.32■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 NPHP1O15259 732 aa35.32■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 GNAI1P63096 354 aa35.32■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP35.32■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF181Q9P0P0 153 aa35.32■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 ST5P78524 1137 aa35.3■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 MYL6BP14649 208 aa35.29■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 PRELPP51888 382 aa35.29■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT24Q2M2I5 525 aa35.28■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 TTLL7Q6ZT98 887 aa35.28■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 IL16Q14005 1332 aa35.28■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM177BA6PVY3 158 aa35.27■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR63Q8IWG1 891 aa35.27■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa35.27■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 RGL2O15211 777 aa35.26■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 NMRK2Q9NPI5 230 aa35.26■■■■□ 3.24
GNPTAB-202ENST00000392919 NFKBIEO00221 500 aa35.24■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 SRGNP10124 158 aa35.24■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 C21orf2O43822 256 aa35.23■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF521Q96K83 1311 aa35.23■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP98P52948 1817 aa35.22■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa35.22■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 CACNA1SQ13698 1873 aa35.22■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 SLX4Q8IY92 1834 aa35.21■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 ERVV-1B6SEH8 477 aa35.21■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 TPTE2Q6XPS3 522 aa35.21■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 PDIA6Q15084 440 aa35.2■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 STYK1Q6J9G0 422 aa35.2■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB3Q9H5J0 574 aa35.2■■■■□ 3.23
GNPTAB-202ENST00000392919 LMNB1P20700 586 aa35.19■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 ERBB4Q15303 1308 aa35.19■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa35.19■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF6Q6ZMV9 814 aa35.19■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 LRP10Q7Z4F1 713 aa35.19■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 MASTLQ96GX5 879 aa35.19■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 ANXA1P04083 346 aa35.18■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 CNKSR1Q969H4 720 aa35.18■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 PROSER3Q2NL68 480 aa35.17■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 HOXB7P09629 217 aa35.16■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 DUSP27Q5VZP5 1158 aa35.16■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 NECTIN2Q92692 538 aa35.16■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 GPTP24298 496 aa35.15■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 C8orf58Q8NAV2 365 aa35.15■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa35.15■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa35.15■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 NUTM1Q86Y26 1132 aa35.14■■■■□ 3.22
GNPTAB-202ENST00000392919 UBN2Q6ZU65 1347 aa35.13■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 FANCIQ9NVI1 1328 aa35.12■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 NPR1P16066 1061 aa35.12■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TIAM2Q8IVF5 1701 aa35.12■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCC12Q96J65 1359 aa35.12■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 KDM2BQ8NHM5 1336 aa35.11■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TOMM70O94826 608 aa35.1■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ERFEQ4G0M1 354 aa35.1■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF34Q8IZ26 560 aa35.1■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TSPYL6Q8N831 410 aa35.1■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 RRAGCQ9HB90 399 aa35.1■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 SUSD4Q5VX71 490 aa35.09■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 C7orf43Q8WVR3 580 aa35.09■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 HSPA6P17066 643 aa35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms