RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384606.1

RNU6-658P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 658, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-658P, Length 106 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-658P-201ENST00000384606 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 SIRT1Q96EB6 747 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 FMNL2Q96PY5 1086 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 MEN1O00255 615 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 THBS1P07996 1170 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 SSFA2P28290 1259 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 FZD5Q13467 585 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLC27A3Q5K4L6 730 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 SIX5Q8N196 739 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 MTMR7Q9Y216 660 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 CARNS1A5YM72 827 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 RAB15P59190 212 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 CHSY3Q70JA7 882 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 OGFOD1Q8N543 542 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 TRIM11Q96F44 468 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 C2CD2LO14523 706 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 APBA3O96018 575 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 ARAFP10398 606 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 ERCC3P19447 782 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 PLVAPQ9BX97 442 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 A0A1W2PRU2 124 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 SPDYE3A6NKU9 549 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 ESPNB1AK53 854 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 WASLO00401 505 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 FGFR3P22607 806 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 DPYDQ12882 1025 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 USP4Q13107 963 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 NLRP3Q96P20 1036 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 CYLDQ9NQC7 956 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-658P-201ENST00000384606 NEURL1BA8MQ27 555 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 M0R2N6 131 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 ATP2B4P23634 1241 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 SEC13P55735 322 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 GTF2IP78347 998 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 CLDN10P78369 228 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 GPAMQ9HCL2 828 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 DKK1O94907 266 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 EGFL7Q9UHF1 273 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 SOWAHDA6NJG2 315 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 ELNP15502 786 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 CTBSQ01459 385 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 LAMC2Q13753 1193 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCDC102BQ68D86 513 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 PGBD3Q8N328 593 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 NACC1Q96RE7 527 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLAIN2Q9P270 581 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 A0A1B0GTH6 734 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 MYCP01106 439 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 ADH6P28332 368 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 CLN3Q13286 438 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 KIAA1024Q9UPX6 916 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 PSME1Q06323 249 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 OCLNQ16625 522 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 EFHC2Q5JST6 749 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 COL26A1Q96A83 441 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 E9PSI1 815 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 BNIP3LO60238 219 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 WEE1P30291 646 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 SERPINB4P48594 390 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 ERVK-9P63128 1117 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 RUBCNLQ9H714 662 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-658P-201ENST00000384606 SFI1A8K8P3 1242 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-658P-201ENST00000384606 BACH1O14867 736 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms