RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376726.3

ACSS1-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

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Gene ACSS1, Length 2,244 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-202ENST00000376726 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 LAMB4A4D0S4 1761 aa29.73■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 MYD88Q99836 296 aa29.72■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 GCKRQ14397 625 aa29.71■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 STRN4Q9NRL3 753 aa29.71■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.71■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 AK9Q5TCS8 1911 aa29.7■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.7■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
ACSS1-202ENST00000376726 ERC1Q8IUD2 1116 aa29.69■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 EVA1CP58658 441 aa29.69■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 FOXD4L1Q9NU39 408 aa29.69■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.69■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 TTC41PQ6P2S7 1318 aa29.67■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.67■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.66■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.66■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.65■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 ST18O60284 1047 aa29.65■■■□□ 2.34
ACSS1-202ENST00000376726 CNTROBQ8N137 903 aa29.64■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 PAPPAQ13219 1627 aa29.63■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 ERBB4Q15303 1308 aa29.63■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 TRAK2O60296 914 aa29.63■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 KCPQ6ZWJ8 1503 aa29.63■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 MCCP23508 829 aa29.63■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.63■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 NBPF26B4DH59 902 aa29.62■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 SASH1O94885 1247 aa29.62■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 NBPF14Q5TI25 921 aa29.62■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 NBPF15Q8N660 670 aa29.62■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.62■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.62■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 IL25Q9H293 177 aa29.61■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 ECHDC1Q9NTX5 307 aa29.61■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 IL27Q8NEV9 243 aa29.6■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 AACSQ86V21 672 aa29.59■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 GBP4Q96PP9 640 aa29.59■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 PALD1Q9ULE6 856 aa29.59■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 ANAPC15P60006 121 aa29.59■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 GPATCH3Q96I76 525 aa29.59■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.58■■■□□ 2.33
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ACSS1-202ENST00000376726 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
ACSS1-202ENST00000376726 SGSM2O43147 1006 aa29.57■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 SIL1Q9H173 461 aa29.57■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 TNS2Q63HR2 1409 aa29.57■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.56■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.56■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 COL15A1P39059 1388 aa29.56■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.56■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 IL17RAQ96F46 866 aa29.56■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 BTG4Q9NY30 223 aa29.56■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 A1BGP04217 495 aa29.55■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 NEK4P51957 841 aa29.55■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 A0A087WZG4 1122 aa29.55■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 SSFA2P28290 1259 aa29.53■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.53■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.53■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 CASP7P55210 303 aa29.53■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 COPRSQ9NQ92 184 aa29.52■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.52■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 HSPA4P34932 840 aa29.52■■■□□ 2.32
ACSS1-202ENST00000376726 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.51■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 FSD2A1L4K1 749 aa29.51■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 RAD50Q92878 1312 aa29.5■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 PTMSP20962 102 aa29.49■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 EVI5LQ96CN4 794 aa29.49■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.49■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 MCM2P49736 904 aa29.48■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 H7C1W4 665 aa29.48■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.47■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 NUCB2P80303 420 aa29.47■■■□□ 2.31
ACSS1-202ENST00000376726 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
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