RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 TXNRD1Q16881 649 aa24.39■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 LY75O60449 1722 aa24.38■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 BEND3Q5T5X7 828 aa24.37■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.37■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 ATP10DQ9P241 1426 aa24.36■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 LINS1Q8NG48 757 aa24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 GNPATO15228 680 aa24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 PROM2Q8N271 834 aa24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 MYD88Q99836 296 aa24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.34■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 AK7Q96M32 723 aa24.34■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.34■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 ALDH1L1O75891 902 aa24.33■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 RPS6KA4O75676 772 aa24.33■■□□□ 1.49
SYTL1-201ENST00000318074 A0A087WZG4 1122 aa24.32■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 COL15A1P39059 1388 aa24.32■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 MEIS3Q99687 375 aa24.31■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.31■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.31■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 RREB1Q92766 1687 aa24.31■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 IGKV5-2P06315 115 aa24.3■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 GNAI3P08754 354 aa24.3■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.29■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 USP44Q9H0E7 712 aa24.29■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.29■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 TCIRG1Q13488 830 aa24.28■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.28■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 C4BP0C0L5 1744 aa24.28■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 BAG6P46379 1132 aa24.27■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 HLFQ16534 295 aa24.27■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.27■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.27■■□□□ 1.48
SYTL1-201ENST00000318074 PHF14O94880 888 aa24.26■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 GCKRQ14397 625 aa24.26■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.26■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.26■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 CAMTA2O94983 1202 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 SMIM5Q71RC9 77 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC125Q86Z20 511 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 GRM8O00222 908 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 GNAI2P04899 355 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 ADRA2BP18089 450 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 ZPR1O75312 459 aa24.24■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 RFC4P35249 363 aa24.23■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.23■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.23■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.23■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.23■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 NARFQ9UHQ1 456 aa24.23■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 SSFA2P28290 1259 aa24.22■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.22■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.22■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 GPTP24298 496 aa24.21■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.21■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.21■■□□□ 1.47
SYTL1-201ENST00000318074 RGL2O15211 777 aa24.2■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.2■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 UTYO14607 1347 aa24.2■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 AKT1S1Q96B36 256 aa24.2■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF827Q17R98 1081 aa24.18■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.18■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 NLRP10Q86W26 655 aa24.18■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.18■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 CEP85Q6P2H3 762 aa24.17■■□□□ 1.46
SYTL1-201ENST00000318074 IGHDP01880 384 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms