RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312511.3

PRM1-201, Transcript of protamine 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRM1, Length 424 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM1-201ENST00000312511 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 STYK1Q6J9G0 422 aa14.64□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 OLFM4Q6UX06 510 aa14.64□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.64□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 CNKSR1Q969H4 720 aa14.64□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 PASKQ96RG2 1323 aa14.64□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 CNTNAP1P78357 1384 aa14.63□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.63□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 MASTLQ96GX5 879 aa14.63□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.63□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 NPHP1O15259 732 aa14.62□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 ST5P78524 1137 aa14.62□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.62□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.62□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 USP16Q9Y5T5 823 aa14.62□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 BCORQ6W2J9 1755 aa14.62□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.61□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 VEGFBP49765 207 aa14.61□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 LDHDQ86WU2 507 aa14.61□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.61□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.6□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.59□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 BTBD11A6QL63 1104 aa14.59□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRM1-201ENST00000312511 CCDC93Q567U6 631 aa14.58□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 SOGA3Q5TF21 947 aa14.58□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 SCN4AP35499 1836 aa14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 FAM177BA6PVY3 158 aa14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 NBPF26B4DH59 902 aa14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 NPR1P16066 1061 aa14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 NBPF15Q8N660 670 aa14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.57□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.56□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 PRKAR2BP31323 418 aa14.56□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 SLC51AQ86UW1 340 aa14.56□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.56□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 WBP1LQ9NX94 342 aa14.56□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 HACL1Q9UJ83 578 aa14.56□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.56□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 EPHX2P34913 555 aa14.55□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 LBX1P52954 281 aa14.55□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 HLFQ16534 295 aa14.55□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.55□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 MCM10Q7L590 875 aa14.55□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.55□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 FZD9O00144 591 aa14.54□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 DCTN1Q14203 1278 aa14.54□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 SYNE4Q8N205 404 aa14.54□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 AIDAQ96BJ3 306 aa14.54□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 SNED1Q8TER0 1413 aa14.54□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 COL4A5P29400 1685 aa14.54□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 CNTROBQ8N137 903 aa14.53□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.53□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 ABCC12Q96J65 1359 aa14.52□□□□□ -0.08
PRM1-201ENST00000312511 RASSF10A6NK89 507 aa14.52□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.52□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.52□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 LTBP1Q14766 1721 aa14.52□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.51□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.51□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.51□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.51□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 GPC2Q8N158 579 aa14.5□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 CRY2Q49AN0 593 aa14.49□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 NGEFQ8N5V2 710 aa14.49□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 ABHD8Q96I13 439 aa14.49□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.49□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 ALDH1B1P30837 517 aa14.48□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 EPS15P42566 896 aa14.48□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 SCNN1DP51172 638 aa14.48□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 PSMD1Q99460 953 aa14.48□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRM1-201ENST00000312511 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
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