RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.89■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 RGL2O15211 777 aa28.89■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.88■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.88■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.87■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.87■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB2P05120 415 aa28.86■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 NUP98P52948 1817 aa28.85■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 COPS6Q7L5N1 327 aa28.85■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.85■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.84■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.83■■■□□ 2.21
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 SETDB2Q96T68 719 aa28.82■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.82■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 UTRNP46939 3433 aa28.81■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA2Q08379 1002 aa28.81■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.81■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.8■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 VAMP4O75379 141 aa28.8■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 TGFB2P61812 414 aa28.79■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.79■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 HYPKQ9NX55 129 aa28.79■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.79■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 SLFN5Q08AF3 891 aa28.78■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.78■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.78■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 ATP10DQ9P241 1426 aa28.77■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 KCNA3P22001 575 aa28.77■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.77■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.77■■■□□ 2.2
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JLW4 131 aa28.76■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 DPEP1P16444 411 aa28.75■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.75■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.75■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 E9PSI1 815 aa28.73■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.73■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.73■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.73■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.191e-9■■□□□ 11.9
SYF2-201ENST00000236273 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.72■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 GPTP24298 496 aa28.71■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 CHRNA5P30532 468 aa28.7■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 TCIRG1Q13488 830 aa28.7■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 SUSD4Q5VX71 490 aa28.7■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 CNBD1Q8NA66 436 aa28.7■■■□□ 2.19
SYF2-201ENST00000236273 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 G2E3Q7L622 706 aa28.69■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.69■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 FAM177BA6PVY3 158 aa28.69■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A2P04920 1241 aa28.69■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.69■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.69■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.67■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 GPR162Q16538 588 aa28.67■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 STK31Q9BXU1 1019 aa28.67■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1FO60840 1977 aa28.66■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 NTSR2O95665 410 aa28.66■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.66■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.66■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.65■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 NLRP10Q86W26 655 aa28.65■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SYF2-201ENST00000236273 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 ST5P78524 1137 aa28.64■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 PARP10Q53GL7 1025 aa28.64■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.64■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 ERFEQ4G0M1 354 aa28.63■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.63■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.62■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.62■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 PDE6BP35913 854 aa28.62■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.62■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 NYXQ9GZU5 481 aa28.62■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 PIM2Q9P1W9 311 aa28.62■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 ABCC12Q96J65 1359 aa28.62■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.61■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 ADCY9O60503 1353 aa28.61■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.6■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 NPHP1O15259 732 aa28.6■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 FLIIQ13045 1269 aa28.6■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 KSR2Q6VAB6 950 aa28.6■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.6■■■□□ 2.17
SYF2-201ENST00000236273 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms