RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 CNKSR1Q969H4 720 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 CAPNS2Q96L46 248 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 CDCA8Q53HL2 280 aa22.71■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.71■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 STYK1Q6J9G0 422 aa22.7■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP44Q96MT7 982 aa22.7■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.7■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 TSKSQ9UJT2 592 aa22.7■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.7■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 SRGNP10124 158 aa22.68■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 ECE1P42892 770 aa22.68■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A6Q13433 755 aa22.68■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.68■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.67■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC93Q567U6 631 aa22.65■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.65■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 MASTLQ96GX5 879 aa22.65■■□□□ 1.22
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WZG4 1122 aa22.63■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 KCNA4P22459 653 aa22.63■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 CNBD1Q8NA66 436 aa22.63■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 LGR6Q9HBX8 967 aa22.63■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 FZD9O00144 591 aa22.62■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 GRM1Q13255 1194 aa22.62■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.62■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 CA12O43570 354 aa22.61■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 AOC2O75106 756 aa22.61■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 MAP2K2P36507 400 aa22.61■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.61■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 CST9Q5W186 159 aa22.6■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 GPC2Q8N158 579 aa22.6■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 COL4A5P29400 1685 aa22.6■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 SNED1Q8TER0 1413 aa22.59■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 ST5P78524 1137 aa22.59■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 DGKZQ13574 1117 aa22.59■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.59■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SPCS1-201ENST00000233025 OLFM4Q6UX06 510 aa22.57■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.57■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 STARD3NLO95772 234 aa22.56■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 SETDB2Q96T68 719 aa22.56■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 TRAF5O00463 557 aa22.55■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 CAMTA2O94983 1202 aa22.55■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 NPHP1O15259 732 aa22.54■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.54■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 NPR1P16066 1061 aa22.53■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 SCNN1DP51172 638 aa22.53■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.52■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPCS1-201ENST00000233025 SOX10P56693 466 aa22.51■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 SYNE4Q8N205 404 aa22.51■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.5■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 EPS15P42566 896 aa22.5■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.5■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 IL13P35225 146 aa22.49■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 PSMD1Q99460 953 aa22.48■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 RNF39Q9H2S5 420 aa22.48■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.48■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.47■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.47■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.47■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 JDP2Q8WYK2 163 aa22.47■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPCS1-201ENST00000233025 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 A1BGP04217 495 aa22.43■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF790Q6PG37 636 aa22.42■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZIC5Q96T25 663 aa22.42■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.41■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH1B1P30837 517 aa22.4■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 NOGQ13253 232 aa22.4■■□□□ 1.18
SPCS1-201ENST00000233025 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
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