RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa15.4■□□□□ 0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bsdc1Q80Y55 427 aa15.4■□□□□ 0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppm1mQ8BU27 406 aa15.4■□□□□ 0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasa1E9PYG6 1038 aa15.4■□□□□ 0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grm8P47743 908 aa15.4■□□□□ 0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnh4A2A5F7 1018 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd23Q812A3 306 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmx3Q8BXZ1 456 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg3Q9CPX6 314 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chmp4cQ9D7F7 232 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mast2Q60592 1734 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crb1Q8VHS2 1405 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MypnQ5DTJ9 1315 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cgnl1Q6AW69 1298 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PogkQ80TC5 607 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gcc1Q9D4H2 778 aa15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa15.38■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igflr1Q3U4N7 345 aa15.38■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb45Q52KG4 520 aa15.38■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Soga3Q6NZL0 945 aa15.38■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CenppQ9CZ92 286 aa15.38■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmox1P14901 289 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tceal9Q9DD24 104 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcmdc2E9Q956 681 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ets1P27577 440 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcaf5Q80T85 946 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prune1Q8BIW1 454 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp6r3Q922D4 844 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erich6bQ9D4S6 220 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DmtnQ9WV69 405 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fkbp5Q64378 456 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa15.37■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slfnl1Q8BHW9 410 aa15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HellsQ60848 821 aa15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankle2Q6P1H6 964 aa15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nyap1Q6PFX7 833 aa15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MypopQ8R4U1 393 aa15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D2X8 372 aa15.36■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GpkowQ56A08 488 aa15.35■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm12185Q5NCB2 835 aa15.35■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golgb1E9PVZ8 3238 aa15.35■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema6bO54951 886 aa15.35■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtmaP26350 111 aa15.35■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa15.35■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BT18 775 aa15.35■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pm20d1Q8C165 503 aa15.35■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa15.34■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fer1l6E0CZ42 1862 aa15.34■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx60E9PZQ1 1711 aa15.34■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adora1Q60612 326 aa15.34■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ripor2Q80U16 1078 aa15.33■□□□□ 0.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9992B2RWK3 458 aa15.33■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa15.33■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc93aQ710D3 458 aa15.33■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim52Q8CDV4 233 aa15.33■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ginm1Q91WR6 327 aa15.33■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shank3Q4ACU6 1730 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Miga2Q8BK03 593 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdpd2Q9ESM6 539 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LratQ9JI60 231 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BcanQ61361 883 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx38Q80X98 1228 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb3Q91X45 518 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kat6bQ8BRB7 1872 aa15.32■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Strn4P58404 760 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcm2P97310 904 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk3Q9JI10 497 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nwd2Q6P5U7 1742 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc9P59268 364 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb1Q91VL9 713 aa15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bicdl1A0JNT9 577 aa15.3■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AppP12023 770 aa15.3■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx58Q6Q899 926 aa15.3■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jmjd4Q8BFT6 427 aa15.3■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc19Q8CC21 365 aa15.3■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myd88P22366 296 aa15.3■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RestQ8VIG1 1082 aa15.3■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ank1Q02357 1862 aa15.29■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gadd45bP22339 160 aa15.29■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neurod6P48986 337 aa15.29■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Morc2aQ69ZX6 1030 aa15.29■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddrgk1Q80WW9 315 aa15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.1 ms