RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pde4bB1AWC9 736 aa25.38■■□□□ 1.65
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Glt1d1A4FUP9 346 aa25.23■■□□□ 1.63
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnnt1O88346 262 aa25.23■■□□□ 1.63
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Aknad1E9Q8N6 675 aa25.21■■□□□ 1.63
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eif6O55135 245 aa25.21■■□□□ 1.63
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Phf23Q8BSN5 401 aa25.17■■□□□ 1.62
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Psd3Q2PFD7 1037 aa25.16■■□□□ 1.62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ly6iQ9WU67 134 aa25.16■■□□□ 1.62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa25.14■■□□□ 1.62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Erbb4Q61527 1308 aa25.14■■□□□ 1.62
Ltb-201ENSMUST00000025262 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa25.14■■□□□ 1.62
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Dpp7Q9ET22 506 aa25.14■■□□□ 1.62
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Eddm13E9Q7F5 164 aa25.07■■□□□ 1.6
Ltb-201ENSMUST00000025262 Psmd1Q3TXS7 953 aa25.07■■□□□ 1.6
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
Ltb-201ENSMUST00000025262 Skor1Q8BX46 964 aa25.07■■□□□ 1.6
Ltb-201ENSMUST00000025262 NynrinQ5DTZ0 1840 aa25.06■■□□□ 1.6
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mical3Q8CJ19 1993 aa25.05■■□□□ 1.6
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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