RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Syde2E9PUP1 1314 aa25.61■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Brf1Q8CFK2 676 aa25.61■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Crb1Q8VHS2 1405 aa25.61■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kcnh4A2A5F7 1018 aa25.6■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gimap5Q8BWF2 308 aa25.6■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa25.6■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Soga3Q6NZL0 945 aa25.59■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 GpkowQ56A08 488 aa25.59■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa25.59■■□□□ 1.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Shank3Q4ACU6 1730 aa25.57■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rad50P70388 1312 aa25.57■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Brpf1B2RRD7 1212 aa25.57■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atp6v1dP57746 247 aa25.56■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smim5Q8BT42 78 aa25.56■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rhot2Q8JZN7 620 aa25.56■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stk3Q9JI10 497 aa25.56■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mrc1Q61830 1456 aa25.56■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hspa2P17156 633 aa25.56■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ssh1Q76I79 1042 aa25.56■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa25.55■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ms4a2P20490 235 aa25.55■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AbraQ8BUZ1 375 aa25.55■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stard3nlQ9DCI3 235 aa25.55■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ehd4Q9EQP2 541 aa25.55■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NmiO35309 314 aa25.54■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Akap11E9Q777 1895 aa25.54■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slc26a8Q8R0C3 999 aa25.54■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cwc25Q9DBF7 416 aa25.54■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adora1Q60612 326 aa25.53■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Jakmip1Q8BVL9 626 aa25.53■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Vwa3bJ9JI28 736 aa25.52■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ddit3P35639 168 aa25.52■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm12185Q5NCB2 835 aa25.52■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Top1mtQ8R4U6 593 aa25.52■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 ApobrQ8VBT6 942 aa25.52■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nav1Q8CH77 1875 aa25.52■■□□□ 1.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AK157302I3ITR1 129 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ddx11Q6AXC6 880 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NexnQ7TPW1 607 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smc4Q8CG47 1286 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 KinQ8K339 391 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Isca1Q9D924 129 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ank1Q02357 1862 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lrp6O88572 1613 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plcb2A3KGF7 1181 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ets1P27577 440 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Q8C5K5 320 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ginm1Q91WR6 327 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mst1rQ62190 1378 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ric1Q69ZJ7 1422 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Filip1lQ6P6L0 1131 aa25.49■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc7Q9D541 371 aa25.49■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Col4a1P02463 1669 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AtrnQ9WU60 1428 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myd88P22366 296 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Strn4P58404 760 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 EspnlQ3UYR4 1005 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tshz3Q8CGV9 1081 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Col22a1E9Q7P1 1613 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cyb5rlB1AS42 316 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Phactr2B1AVP0 632 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mlh1Q9JK91 760 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sos2Q02384 1333 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mcm4P49717 862 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sik1Q60670 779 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam213aQ9CYH2 218 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cap2Q9CYT6 476 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prl3d2F6R3P9 224 aa25.45■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 EvcP57680 1005 aa25.45■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa25.45■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pde4dQ01063 747 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sult6b1P0CC03 303 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ifit2Q64112 472 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Bag4Q8CI61 457 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Bloc1s4Q8VED2 215 aa25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 126.4 ms