RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	CDC9	P04819	755 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	MSM1	P22438	575 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	DAL3	P32459	195 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	DYS1	P38791	387 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	FIR1	P40020	876 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	BEM3	P32873	1128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	BCD1	P38772	366 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YNL165W	P53891	406 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PEX28	P38848	579 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	QRI7	P43122	407 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	CNN1	P43618	361 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	INO1	P11986	533 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SFL1	P20134	766 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	GSY1	P23337	708 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	FBP26	P32604	452 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SAS3	P34218	831 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YEL1	P34225	687 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PEX5	P35056	612 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RXT2	P38255	430 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PAN5	P38787	379 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	CAJ1	P39101	391 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	QDR2	P40474	542 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	IML2	P47031	731 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	APP1	P53933	587 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	TLG1	Q03322	224 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PML39	Q03760	334 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	MOD5	P07884	428 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RAD53	P22216	821 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PPH3	P32345	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RDH54	P38086	958 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	CKB2	P38930	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RSM26	P47141	266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	GTR1	Q00582	310 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	ERO1	Q03103	563 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SPO16	P17122	198 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
TYW1	YPL207W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
TYW1	YPL207W	YBR284W	P38150	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	CAF120	P53836	1060 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RAD18	P10862	487 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SPC29	P33419	253 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SQT1	P35184	431 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YPL191C	Q08930	360 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YPK9	Q12697	1472 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	AAD3	P25612	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	TBS1	P38114	1094 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	BIT2	P38346	545 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	BSD2	P38356	321 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RRN7	P40992	514 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	BFA1	P47113	574 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	ENT3	P47160	408 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	ROD1	Q02805	837 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YDR286C	Q05530	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	WTM2	Q12206	467 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SAN1	P22470	610 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YGL176C	P46945	554 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YNR063W	P53749	607 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SCM3	Q12334	223 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RKM4	Q12504	494 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	SCC2	Q04002	1493 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YAP1802	P53309	568 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	YNL058C	P53947	316 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	NSE5	Q03718	556 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	TAF11	Q04226	346 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	RMP1	Q12530	201 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TYW1	YPL207W	UFD4	P33202	1483 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TYW1	YPL207W	STE6	P12866	1290 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TYW1	YPL207W	IDI1	P15496	288 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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