RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YVC1	YOR087W	ERS1	P17261	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YEL1	P34225	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	MGS1	P40151	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	GPG1	P53130	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	VPS72	Q03388	795 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	SPC29	P33419	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	NNK1	P36003	928 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	ALG14	P38242	237 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	ACM1	Q08981	209 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	CDC9	P04819	755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	SRD1	P09007	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	BAP2	P38084	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	MXR1	P40029	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YJR120W	P47157	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	DSE4	P53753	1117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	HFD1	Q04458	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	REC104	P33323	182 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	TOK1	P40310	691 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	NIT1	P40447	199 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YIR007W	P40566	764 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	AFR1	P33304	620 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	SLA2	P33338	968 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	GPB2	P39717	880 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	COG8	Q04632	607 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	SLX4	Q12098	748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	PCL2	P25693	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	MET22	P32179	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	PRO1	P32264	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YBR071W	P38243	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	ACO2	P39533	789 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	DAM1	P53267	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	NHA1	Q99271	985 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	ATP4	P05626	244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	RAD18	P10862	487 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	MTC2	P34246	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	MET13	P53128	600 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	ATP25	Q03153	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	TRE2	Q08693	809 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	NPP1	P25353	742 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	EUG1	P32474	517 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	EMC3	P36039	253 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	CAF16	P43569	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	GYP8	P43570	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YJL045W	P47052	634 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	COG6	P53959	839 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	SFL1	P20134	766 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	ERT1	P38140	529 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
YVC1	YOR087W	NIT3	P49954	291 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	TNA1	P53322	534 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	YKL151C	P36059	337 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	UGA2	P38067	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	FUI1	P38196	639 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	GYP7	P48365	746 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	PEX14	P53112	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	SRC1	Q03707	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	SND1	Q04007	877 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	RSC3	Q06639	885 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	KAR1	P11927	433 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YVC1	YOR087W	DAS1	P47005	663 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.4 ms