RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A HUL5P53119 910 aa5.24□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A CDC53Q12018 815 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A OSH2Q12451 1283 aa5.24□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A SRP40P32583 406 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A YKL151CP36059 337 aa5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A YHR020WP38708 688 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A SEC26P41810 973 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A ERP6P53198 216 aa5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A UTP8P53276 713 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A ORC1P54784 914 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A HRQ1Q05549 1077 aa5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A DUS3Q06053 668 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A ACE2P21192 770 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A CDC12P32468 407 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A RRT14P40470 206 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A ALR2P43553 858 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A FOL2P51601 243 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A ENV11P53246 860 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A SRP1Q02821 542 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A EAF1Q06337 982 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A YDR306CQ06640 478 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A YLL058WQ12198 575 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A SVS1Q12254 260 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR347W-AYLR347W-A HSP60P19882 572 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A HBS1P32769 611 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A YKL091CP33324 310 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A SAH1P39954 449 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A MTC3P53077 123 aa5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A YGR125WP53273 1036 aa5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A TPO2P53283 614 aa5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A FLC1Q08967 793 aa5.21□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A CIT1P00890 479 aa5.2□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A ARE1P25628 610 aa5.2□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A AAR2P32357 355 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A RFC5P38251 354 aa5.2□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data5.2□□□□□ -1.58not detected
YLR347W-AYLR347W-A RPN4Q03465 531 aa5.2□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A UBX5Q06682 500 aa5.2□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A MDM38Q08179 573 aa5.2□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A YOR131CQ12486 218 aa5.2□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A PPH3P32345 308 aa5.19□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A SIT1P39980 628 aa5.19□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A DFG16Q99234 619 aa5.19□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A SCT1P32784 759 aa5.18□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A CCC2P38995 1004 aa5.18□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A RSP5P39940 809 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A HFM1P51979 1187 aa5.18□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A RSM24Q03976 319 aa5.18□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A YDL177CQ12257 170 aa5.18□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A RIB2Q12362 591 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A KIN2P13186 1147 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A APL1P27351 700 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A FUN30P31380 1131 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A CDC11P32458 415 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A LRG1P35688 1017 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A ETP1P38748 585 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A GIC1P38785 314 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A GGA2P38817 585 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A HUL4P40985 892 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A ECL1P48235 211 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A SRT1Q03175 343 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A TAF8Q03750 510 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A PPM2Q08282 695 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A HBN1Q96VH4 193 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A ADE8P04161 214 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A GAL11P19659 1081 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A AFR1P33304 620 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data5.16□□□□□ -1.58not detected
YLR347W-AYLR347W-A BUD6P41697 788 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data5.16□□□□□ -1.58not detected
YLR347W-AYLR347W-A SIZ1Q04195 904 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A OSW2Q12202 724 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR347W-AYLR347W-A CAN1P04817 590 aa5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A NPP1P25353 742 aa5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A YKR078WP36158 585 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A YRO2P38079 344 aa5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A NPP2P39997 493 aa5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A GYP7P48365 746 aa5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A BUL2Q03758 920 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A XYL2Q07993 356 aa5.15□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A CYC1P00044 109 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A CIT2P08679 460 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A YBR284WP38150 797 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A TSL1P38427 1098 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A YAP1801P38856 637 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A SNO2P53823 222 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A MSC2Q03455 724 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A LCD1Q04377 747 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A YPR071WQ12346 211 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A TOP3P13099 656 aa5.13□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A SRM1P21827 482 aa5.13□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A PET10P36139 283 aa5.13□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A BET3P36149 193 aa5.13□□□□□ -1.59
YLR347W-AYLR347W-A YER158CP40095 573 aa5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.5 ms