RNA–Protein interactions for RNA: YKL017C

HCS1, Transcript of Hexameric DNA polymerase alpha-associated DNA helicase A, yeast

Gene HCS1, Length 2,052 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HCS1	YKL017C	RRT14	P40470	206 aa		3.17	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	MRPS18	P42847	217 aa		3.17	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	UGA2	P38067	497 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	MXR1	P40029	184 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	MPH1	P40562	993 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	GNP1	P48813	663 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	WHI5	Q12416	295 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	BI4	P03879	638 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	ZRG8	P40021	1076 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	HFM1	P51979	1187 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCS1	YKL017C	GEM1	P39722	662 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	THI12	P42883	340 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	THI5	P43534	340 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	THI11	P47183	340 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	YGR122W	P53272	402 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	THI13	Q07748	340 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	ACM1	Q08981	209 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	KCS1	Q12494	1050 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	ENA1	P13587	1091 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	ENA2	Q01896	1091 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	MRL1	Q06815	381 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	BDF2	Q07442	638 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	ENA5	Q12691	1091 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	SLA2	P33338	968 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	GNT1	Q12096	491 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	GCR1	P07261	785 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	RAD2	P07276	1031 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	ATF1	P40353	525 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
HCS1	YKL017C	XYL2	Q07993	356 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	ENB1	Q08299	606 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	SNM1	P40993	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	STU2	P46675	888 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	MTC3	P53077	123 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	LAS17	Q12446	633 aa		3.12	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	TMN2	Q04562	672 aa		3.11	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	YOL073C	Q08232	322 aa		3.11	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	YLR040C	Q07988	224 aa		3.1	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	CYC8	P14922	966 aa		3.1	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	RER2	P35196	286 aa		3.1	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	MCM7	P38132	845 aa		3.1	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	PNT1	P38969	423 aa		3.1	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	OSW2	Q12202	724 aa		3.1	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	SUL1	P38359	859 aa		3.09	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	YAP1801	P38856	637 aa		3.09	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	YGR012W	P53206	393 aa		3.09	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	MCH5	Q08777	521 aa		3.09	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	NPC2	Q12408	173 aa		3.09	□□□□□ -1.91
HCS1	YKL017C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	BUL1	P48524	976 aa		3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	STB4	P50104	949 aa		3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	NCS6	P53088	359 aa		3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	CDA1	Q06702	301 aa		3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	KTR4	P38131	464 aa		3.08	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	SPE1	P08432	466 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	KAR4	P25583	335 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	RAD27	P26793	382 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	IRC10	Q08118	586 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	GUP2	Q08929	609 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	SEC20	P28791	383 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	ERG4	P25340	473 aa		3.06	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	OMS1	Q06668	471 aa		3.06	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	ACF2	Q12168	779 aa		3.06	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	HSF1	P10961	833 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	CCC2	P38995	1004 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	SRP101	P32916	621 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	ATG19	P35193	415 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	RTT10	Q08924	1013 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	YKL151C	P36059	337 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	IPL1	P38991	367 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	TIM44	Q01852	431 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	YLL058W	Q12198	575 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	YMR206W	Q03695	313 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	MDM38	Q08179	573 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	MTH1	P35198	433 aa		3.03	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
HCS1	YKL017C	MCM2	P29469	868 aa		3.02	□□□□□ -1.93
HCS1	YKL017C	RNT1	Q02555	471 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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