RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	STB4	P50104	949 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM16	YJL104W	AFT2	Q08957	416 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM16	YJL104W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM16	YJL104W	MKK2	P32491	506 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM16	YJL104W	UGA2	P38067	497 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM16	YJL104W	ROD1	Q02805	837 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM16	YJL104W	NPC2	Q12408	173 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM16	YJL104W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	MLS1	P30952	554 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	SIW14	P53965	281 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	BI4	P03879	638 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	CNN1	P43618	361 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	HOF1	Q05080	669 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	ACM1	Q08981	209 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	MTH1	P35198	433 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	PIC2	P40035	300 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	HFM1	P51979	1187 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	YMR206W	Q03695	313 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	YAP7	Q08182	245 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	ERG4	P25340	473 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	PEX2	P32800	271 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	SPC42	P36094	363 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	CCC2	P38995	1004 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	FAA3	P39002	694 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	BUL1	P48524	976 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	RNT1	Q02555	471 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	GUP2	Q08929	609 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	LAS17	Q12446	633 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	SPE1	P08432	466 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	GEM1	P39722	662 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	YGR012W	P53206	393 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	GND2	P53319	492 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	ICT1	Q12385	394 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	KAR4	P25583	335 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	ATG19	P35193	415 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	TOS4	Q06266	489 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	MCD1	Q12158	566 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	OSW2	Q12202	724 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	SEC8	P32855	1065 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	MXR1	P40029	184 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	NCS6	P53088	359 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	GNT1	Q12096	491 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAM16	YJL104W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	SLA2	P33338	968 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	YHL050C	P38721	697 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	YAP1801	P38856	637 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	YHR219W	P38900	624 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MPH1	P40562	993 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MUK1	Q02866	612 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	COQ11	Q05892	277 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	XYL2	Q07993	356 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	TMT1	P32643	299 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	SDS3	P40505	327 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	IMO32	P53219	342 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	SEC5	P89102	971 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	CDA1	Q06702	301 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	HAT1	Q12341	374 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	HSF1	P10961	833 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MDM10	P18409	493 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	SRP101	P32916	621 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MCM7	P38132	845 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	HXT13	P39924	564 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MRPS18	P42847	217 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	HXT17	P53631	564 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	HXT15	P54854	567 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MRL1	Q06815	381 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	ALG7	P07286	448 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MET4	P32389	672 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	PPZ2	P33329	710 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	GEF1	P37020	779 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	PPX1	P38698	397 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	DAS1	P47005	663 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	GNP1	P48813	663 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	GLO1	P50107	326 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PAM16	YJL104W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.03	□□□□□ -1.92	not detected
PAM16	YJL104W	BNR1	P40450	1375 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	YHL017W	P38745	532 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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