RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data4.81□□□□□ -1.64not detected
SNX4YJL036W SVS1Q12254 260 aa4.81□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W RAD53P22216 821 aa4.8□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W SYP1P25623 870 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W RMD1Q03441 430 aa4.8□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W YAP6Q03935 383 aa4.8□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W YLR224WQ05947 369 aa4.8□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W PMA1P05030 918 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W RAD2P07276 1031 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W YER152CP10356 443 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W HXT13P39924 564 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W CNN1P43618 361 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W HXT17P53631 564 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W HXT15P54854 567 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W DOS2P54858 310 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W VPS16Q03308 798 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W SIZ1Q04195 904 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W ATG13Q06628 738 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W CYC8P14922 966 aa4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W APL1P27351 700 aa4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W MLS1P30952 554 aa4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W PET112P33893 541 aa4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W GNP1P48813 663 aa4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data4.78□□□□□ -1.64not detected
SNX4YJL036W HMI1Q12039 706 aa4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W PIN2Q12057 282 aa4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W DBP5P20449 482 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W EMC1P25574 760 aa4.77□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W DCG1P32460 244 aa4.77□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W PPG1P32838 368 aa4.77□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W CWC24P53769 259 aa4.77□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W KIN4Q01919 800 aa4.77□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W MRL1Q06815 381 aa4.77□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W GCV2P49095 1034 aa4.76□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W RNH70P53331 553 aa4.76□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W YML122CQ03207 126 aa4.76□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W BAS1P22035 811 aa4.75□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W DEF1P35732 738 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W MSS4P38994 779 aa4.75□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W OSW7P43611 510 aa4.75□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W MSC2Q03455 724 aa4.75□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W GCR1P07261 785 aa4.74□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W MPH1P40562 993 aa4.74□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W YJL049WP47048 450 aa4.74□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W ACE2P21192 770 aa4.73□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W MNR2P35724 969 aa4.73□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W SIP5P40210 489 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W RRT14P40470 206 aa4.73□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W IOC3P43596 787 aa4.73□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W RAD27P26793 382 aa4.72□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W RRP14P36080 434 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W UGA2P38067 497 aa4.72□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W NSE3Q05541 303 aa4.72□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W ACM1Q08981 209 aa4.72□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W GNT1Q12096 491 aa4.72□□□□□ -1.65
SNX4YJL036W THS1P04801 734 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W PLB1P39105 664 aa4.71□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W GEM1P39722 662 aa4.71□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W YOR131CQ12486 218 aa4.71□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data4.7□□□□□ -1.66not detected
SNX4YJL036W RER2P35196 286 aa4.7□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W FPR3P38911 411 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W MXR1P40029 184 aa4.7□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W BI4P03879 638 aa4.69□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W CIT2P08679 460 aa4.69□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W MCM7P38132 845 aa4.69□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W MND2P40577 368 aa4.69□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W ALG12P53730 551 aa4.69□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W GDE1Q02979 1223 aa4.69□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W PPM2Q08282 695 aa4.69□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W RTT10Q08924 1013 aa4.69□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W RPN4Q03465 531 aa4.68□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W TPO1Q07824 586 aa4.68□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W GRX1P25373 110 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W SLA2P33338 968 aa4.67□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data4.67□□□□□ -1.66not detected
SNX4YJL036W POA1P38218 177 aa4.67□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W MET12P46151 657 aa4.67□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W HFM1P51979 1187 aa4.67□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W BDF2Q07442 638 aa4.67□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W ADY3Q07732 790 aa4.67□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W CDC34P14682 295 aa4.66□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W PRI2P20457 528 aa4.66□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W DBP2P24783 546 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.6 ms