RNA–Protein interactions for RNA: YBR293W

VBA2, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA2, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA2	YBR293W	UBP1	P25037	809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	ASF1	P32447	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	ECM4	P36156	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	PCH2	P38126	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SHC1	P39000	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YIL001W	P40560	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	RCF1	Q03713	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	MMR1	Q06324	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	CTI6	Q08923	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SPO14	P36126	1683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	JIP3	O13555	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	CDC16	P09798	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SEG2	P34250	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SRL3	P36167	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	PIH1	P38768	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	IPL1	P38991	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	MRX1	P40050	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	PXA1	P41909	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	TAF1	P46677	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	ORM1	P53224	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	DSL1	P53847	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	RCM1	P53972	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	WAR1	Q03631	944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	APL4	Q12028	832 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	RAD1	P06777	1100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	GPA1	P08539	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	TYR1	P20049	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	ARG1	P22768	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	KCC4	P25389	1037 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SEC20	P28791	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SLA1	P32790	1244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YEL1	P34225	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	NUP60	P39705	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	JJJ3	P47138	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SPO1	P53541	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	MET7	Q08645	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	DIT1	P21623	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	CDC15	P27636	974 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	IRE1	P32361	1115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YER130C	P39959	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	VID27	P40157	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	FYV10	P40492	516 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YIR042C	P40586	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	MIC19	P43594	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SHE10	P53075	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	BTN2	P53286	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	VPS75	P53853	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	ALF1	P53904	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	TFB2	Q02939	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	YML119W	Q03208	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	PSR1	Q07800	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	VMR1	P38735	1592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA2	YBR293W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	NUP192	P47054	1683 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SWI5	P08153	709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	IME1	P21190	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	GSY2	P27472	705 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PEP12	P32854	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	CSE1	P33307	960 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PTH2	P34222	208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PPX1	P38698	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	BUD16	P39988	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ICP55	P40051	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	JJJ2	P46997	583 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YPT11	P48559	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ECM23	Q02710	187 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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