RNA–Protein interactions for RNA: YBL027W

RPL19B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L19B, yeast

Gene RPL19B, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL19B	YBL027W	NIT1	P40447	199 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPL19B	YBL027W	NSE3	Q05541	303 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPL19B	YBL027W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	FAR11	P53917	953 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	SDH1	Q00711	640 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	GIC2	Q06648	383 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	YFL040W	P43562	540 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	MTC3	P53077	123 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	VPS62	P53285	467 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	CTR9	P89105	1077 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	GEF1	P37020	779 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	GSM1	P42950	618 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	VPS64	Q03944	604 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	ADR1	P07248	1323 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	ERG7	P38604	731 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	SPL2	P38839	148 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	YIG1	Q08956	461 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	FLO1	P32768	1537 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	GPT2	P36148	743 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	RIM11	P38615	370 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	MMM1	P41800	426 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	NET1	P47035	1189 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	GCV1	P48015	400 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	ATG1	P53104	897 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	YNL050C	P53952	270 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	UFD2	P54860	961 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	FMP30	Q02883	468 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	PKH1	Q03407	766 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	PPM2	Q08282	695 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	TOR1	P35169	2470 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
RPL19B	YBL027W	LRG1	P35688	1017 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	CIT3	P43635	486 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	ZDS2	P54786	942 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	RSC4	Q02206	625 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	SAC3	P46674	1301 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RPL19B	YBL027W	RNQ1	P25367	405 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	MGM1	P32266	881 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	SEG2	P34250	1132 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	QDR1	P40475	563 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	AIM21	P40563	679 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	KAR5	Q04746	504 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	TOS4	Q06266	489 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	ICL2	Q12031	575 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	PSF3	Q12146	194 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	AHC1	Q12433	566 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	NPR1	P22211	790 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	DUR3	P33413	735 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	ECL1	P48235	211 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	DNM1	P54861	757 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	IRC4	Q03036	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	FCP1	Q03254	732 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	THI3	Q07471	609 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	DFG16	Q99234	619 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	RAD53	P22216	821 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	OCT1	P35999	772 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	MAM1	P40065	302 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	NSI1	Q12457	570 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	COQ4	O13525	335 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	UIP5	P36137	443 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	YHR131C	P38835	850 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	UBP5	P39944	805 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	YJR008W	P47085	338 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	MCD4	P36051	919 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPL19B	YBL027W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 82.5 ms