RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 MX1P20591 662 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 DDIT3P35638 169 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 ATP8B2P98198 1209 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 CHRNA2Q15822 529 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD24Q8TF21 1146 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 ESPNB1AK53 854 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 NEK4P51957 841 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 ERBB4Q15303 1308 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 GNAI3P08754 354 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 CASC1Q6TDU7 716 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 TPM2P07951 284 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.39■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.39■□□□□ 0.54
CTIF-205ENST00000587860 ERC2O15083 957 aa18.39■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.39■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 MYL6BP14649 208 aa18.39■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.39■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.39■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 NWD1Q149M9 1564 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 MCTP1Q6DN14 999 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 FMN2Q9NZ56 1722 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 RABEP1Q15276 862 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 KLHDC4Q8TBB5 520 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 SIL1Q9H173 461 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 REC8O95072 547 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 CPA1P15085 419 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 CHMLP26374 656 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 PXDNQ92626 1479 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 SPG7Q9UQ90 795 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 BEND3Q5T5X7 828 aa18.33■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 RHPN1Q8TCX5 695 aa18.33■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 GBP4Q96PP9 640 aa18.33■□□□□ 0.53
CTIF-205ENST00000587860 ANKARQ7Z5J8 1434 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 VGLL3A8MV65 326 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 HSPA2P54652 639 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 RGPD2P0DJD1 1756 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 ST18O60284 1047 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 SSH3Q8TE77 659 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 ADCY9O60503 1353 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 TMX3Q96JJ7 454 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 GDPD2Q9HCC8 539 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 LTN1O94822 1766 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 FSD2A1L4K1 749 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CTIF-205ENST00000587860 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTIF-205ENST00000587860 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CTIF-205ENST00000587860 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-205ENST00000587860 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-205ENST00000587860 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTIF-205ENST00000587860 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.26■□□□□ 0.51
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