RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ELP1O95163 1332 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 SLIT1O75093 1534 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 FLIIQ13045 1269 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 NCAPD2Q15021 1401 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 METP08581 1390 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 TNRQ92752 1358 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC192P0DO97 292 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMA5P28066 241 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 VPS53Q5VIR6 699 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ZMYND15Q9H091 742 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 SGSM2O43147 1006 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 STX6O43752 255 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM193AP78312 1265 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 MTX1Q13505 466 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 POLA2Q14181 598 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNB2Q92953 911 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPOAP1O95153 1857 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM83GA6ND36 823 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 NEMFO60524 1076 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM4AO75164 1064 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 F13A1P00488 732 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF20Q5VTR2 975 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF3AQ9Y496 699 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ACEP12821 1306 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ALDH1L1O75891 902 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT85P78386 507 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 PKP1Q13835 747 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 TAF3Q5VWG9 929 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 USP48Q86UV5 1035 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 RILPL2Q969X0 211 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC14Q96N46 770 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 FEZ1Q99689 392 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 SNRKQ9NRH2 765 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 TUBB4AP04350 444 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT32Q14532 448 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 ATL3Q6DD88 541 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 MCM10Q7L590 875 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3C2AO00443 1686 aa9.21□□□□□ -0.93
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-202ENST00000586851 CTAGE5O15320 804 aa9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-202ENST00000586851 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF20AO95235 890 aa9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-202ENST00000586851 ADCY5O95622 1261 aa9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-202ENST00000586851 AMPHP49418 695 aa9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-202ENST00000586851 DCTN1Q14203 1278 aa9.21□□□□□ -0.94
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