RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 STARD3NLO95772 234 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-211ENST00000567642 DPEP1P16444 411 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-211ENST00000567642 DDR1Q08345 913 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-211ENST00000567642 BCS1LQ9Y276 419 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-211ENST00000567642 FCHSD2O94868 740 aa27.96■■■□□ 2.07
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PPP4C-211ENST00000567642 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP4C-211ENST00000567642 ATP10DQ9P241 1426 aa27.94■■■□□ 2.06
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PPP4C-211ENST00000567642 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.93■■■□□ 2.06
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PPP4C-211ENST00000567642 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.87■■■□□ 2.05
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PPP4C-211ENST00000567642 ADCY9O60503 1353 aa27.86■■■□□ 2.05
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PPP4C-211ENST00000567642 CHRNA5P30532 468 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP4C-211ENST00000567642 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.85■■■□□ 2.05
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PPP4C-211ENST00000567642 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
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PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP4C-211ENST00000567642 SCN7AQ01118 1682 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP4C-211ENST00000567642 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.82■■■□□ 2.04
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PPP4C-211ENST00000567642 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.78■■■□□ 2.04
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PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.78■■■□□ 2.04
PPP4C-211ENST00000567642 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.78■■■□□ 2.04
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PPP4C-211ENST00000567642 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.75■■■□□ 2.03
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PPP4C-211ENST00000567642 SBF1O95248 1867 aa27.74■■■□□ 2.03
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.74■■■□□ 2.03
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PPP4C-211ENST00000567642 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.73■■■□□ 2.03
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PPP4C-211ENST00000567642 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.73■■■□□ 2.03
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PPP4C-211ENST00000567642 H0YIN7 160 aa27.71■■■□□ 2.03
PPP4C-211ENST00000567642 NPHP1O15259 732 aa27.71■■■□□ 2.03
PPP4C-211ENST00000567642 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.71■■■□□ 2.03
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PPP4C-211ENST00000567642 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
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PPP4C-211ENST00000567642 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.69■■■□□ 2.02
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PPP4C-211ENST00000567642 CACNA1SQ13698 1873 aa27.68■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.67■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 RNF181Q9P0P0 153 aa27.67■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.66■■■□□ 2.02
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PPP4C-211ENST00000567642 PDE6BP35913 854 aa27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 NBPF15Q8N660 670 aa27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 CNBD1Q8NA66 436 aa27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 KIF3CO14782 793 aa27.64■■■□□ 2.02
PPP4C-211ENST00000567642 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 ST5P78524 1137 aa27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 RASSF7Q02833 373 aa27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 RIPK4P57078 832 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
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