RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.01■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 CACNA1FO60840 1977 aa26■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 TTC22Q5TAA0 569 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 KSR2Q6VAB6 950 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 BTG4Q9NY30 223 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 HYPKQ9NX55 129 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 SRGAP3O43295 1099 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 IL2RBP14784 551 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 COPS6Q7L5N1 327 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-205ENST00000550376 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 SDSP20132 328 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 PDE1AP54750 535 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 SSH3Q8TE77 659 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 CDC45O75419 566 aa25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 IGKV5-2P06315 115 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-205ENST00000550376 ABCC6O95255 1503 aa25.89■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 C5P01031 1676 aa25.88■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 BECN1Q14457 450 aa25.88■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 MYD88Q99836 296 aa25.88■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 POLA2Q14181 598 aa25.87■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.87■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 ADAMTS2O95450 1211 aa25.86■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 LINS1Q8NG48 757 aa25.86■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.86■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 SUCLG2Q96I99 432 aa25.86■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.85■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 MX1P20591 662 aa25.85■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.85■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 KAZALD1Q96I82 304 aa25.85■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 ABCA3Q99758 1704 aa25.85■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 ALDH1L1O75891 902 aa25.85■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 A1BGP04217 495 aa25.85■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.84■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 GRM8O00222 908 aa25.84■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 NBPF26B4DH59 902 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 PIP4K2BP78356 416 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 NBPF14Q5TI25 921 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 NBPF15Q8N660 670 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM4-205ENST00000550376 KIF2CQ99661 725 aa25.83■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 MRC1P22897 1456 aa25.82■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.82■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.82■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 RILPL2Q969X0 211 aa25.82■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.81■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.81■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.81■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.81■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.8■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.8■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.8■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.79■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.79■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.78■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 GCKRQ14397 625 aa25.78■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 SIL1Q9H173 461 aa25.78■■□□□ 1.72
PRDM4-205ENST00000550376 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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