RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 ZPR1O75312 459 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-216ENST00000526055 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-216ENST00000526055 COL15A1P39059 1388 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-216ENST00000526055 GRIN3BO60391 1043 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 DCTN1Q14203 1278 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 NARFQ9UHQ1 456 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A087WZG4 1122 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNQ3O43525 872 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 TGFB2P61812 414 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 FKBP8Q14318 412 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 TM4SF1P30408 202 aa24.33■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.33■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.32■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.32■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 DDR1Q08345 913 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 USP16Q9Y5T5 823 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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TSPAN4-216ENST00000526055 RIPK4P57078 832 aa24.29■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.29■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 RUNDC1Q96C34 613 aa24.28■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.28■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.28■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 NFIXQ14938 502 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN4-216ENST00000526055 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.25■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.25■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 RGL2O15211 777 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A0G2JLW4 131 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 CAMTA2O94983 1202 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 SERPINB2P05120 415 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 DPEP1P16444 411 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 SCN7AQ01118 1682 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN4-216ENST00000526055 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF26B4DH59 902 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNA3P22001 575 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF15Q8N660 670 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 PIM2Q9P1W9 311 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 ERBB4Q15303 1308 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 SETDB2Q96T68 719 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 BCS1LQ9Y276 419 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 NEUROD2Q15784 382 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 BCORQ6W2J9 1755 aa24.14■■□□□ 1.46
TSPAN4-216ENST00000526055 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 CHL1O00533 1208 aa24.12■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 ANP32CO43423 234 aa24.12■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 CHRNA5P30532 468 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 PDE6BP35913 854 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 CNBD1Q8NA66 436 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 ADCY9O60503 1353 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 H0YIN7 160 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 APAF1O14727 1248 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 ST5P78524 1137 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4-216ENST00000526055 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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