RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, human

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC13-208	ENST00000522399	DDR1	Q08345	913 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TTC13-208	ENST00000522399	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
TTC13-208	ENST00000522399	STARD3NL	O95772	234 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC13-208	ENST00000522399	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC13-208	ENST00000522399	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC13-208	ENST00000522399	NARF	Q9UHQ1	456 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF790	Q6PG37	636 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TTC13-208	ENST00000522399	FCHSD2	O94868	740 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	TM4SF1	P30408	202 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.05	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	PIM2	Q9P1W9	311 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	KCNA3	P22001	575 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TTC13-208	ENST00000522399	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		33.01	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399		A0A087WZG4	1122 aa		33	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	NFIX	Q14938	502 aa		33	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	CHRNA5	P30532	468 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC13-208	ENST00000522399	SERPINB2	P05120	415 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	KCNQ3	O43525	872 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	MCM10	Q7L590	875 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	SCN7A	Q01118	1682 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TTC13-208	ENST00000522399	NEFM	P07197	916 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	CEP350	Q5VT06	3117 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	A1BG	P04217	495 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	KIF3C	O14782	793 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TTC13-208	ENST00000522399	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399		H0YIN7	160 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	TTLL6	Q8N841	843 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	RNF181	Q9P0P0	153 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	SBF1	O95248	1867 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.76	■■■□□ 2.84
TTC13-208	ENST00000522399	HSPA6	P17066	643 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	PDE6B	P35913	854 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	NPHP1	O15259	732 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	TOMM70	O94826	608 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	ST5	P78524	1137 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	RASSF7	Q02833	373 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83	2e-8	■■■□□ 17.9
TTC13-208	ENST00000522399	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TTC13-208	ENST00000522399	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.7	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	LMNB1	P20700	586 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	RALBP1	Q15311	655 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
TTC13-208	ENST00000522399	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82

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