RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPR153Q6NV75 609 aa7.45□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADAM32Q8TC27 787 aa7.45□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 CITED4Q96RK1 184 aa7.45□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ITGAEP38570 1179 aa7.45□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.45□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 CFHP08603 1231 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 BIRC2Q13490 618 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ODR4Q5SWX8 454 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 GGT7Q9UJ14 662 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 PTK2Q05397 1052 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.44□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 COL26A1Q96A83 441 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 PNMA2Q9UL42 364 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 CTHP32929 405 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 FANCLQ9NW38 375 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 AK5Q9Y6K8 562 aa7.43□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 SH3BP5O60239 455 aa7.42□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.42□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATCAYQ86WG3 371 aa7.42□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 NME8Q8N427 588 aa7.42□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 TNFRSF10BO14763 440 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAFGO15525 162 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRC1O43663 620 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPRASP2Q96D09 838 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 SNTG2Q9NY99 539 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ESPNB1AK53 854 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 APLP1P51693 650 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 EVA1CP58658 441 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 C12orf49Q9H741 205 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.41□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 POTEB3A0JP26 581 aa7.4□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZBTB39O15060 712 aa7.4□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 NEFLP07196 543 aa7.4□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 CHMP4BP1P59074 171 aa7.4□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 DOK7Q18PE1 504 aa7.4□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAP9Q49MG5 647 aa7.4□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 MORN1Q5T089 497 aa7.4□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 POTEBQ6S5H4 581 aa7.4□□□□□ -1.22
CSNK1G3-210ENST00000521364 CDC45O75419 566 aa7.4□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ETFBP38117 255 aa7.4□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM26DQ5JW98 314 aa7.4□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.4□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.4□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 MKL1Q969V6 931 aa7.4□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 C16orf46Q6P387 395 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 FERMT3Q86UX7 667 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 NBPF4Q96M43 638 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 COPRSQ9NQ92 184 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 LHX6Q9UPM6 363 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 GYS2P54840 703 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 C4orf46Q504U0 113 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 PGBD3Q8N328 593 aa7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 PTPREP23469 700 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDE6BP35913 854 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 RASA3Q14644 834 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMTC2Q8N394 836 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM205CA6NFA0 338 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 IGFBP4P22692 258 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAF1Q9H063 256 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 EID1Q9Y6B2 187 aa7.38□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ESYT3A0FGR9 886 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 FOXO3O43524 673 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ORC1Q13415 861 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms