RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517278.1

RNU6-1174P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1174, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1174P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1174P-201ENST00000517278 THBS1P07996 1170 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CCNYL3P0C7X3 344 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KRTAP10-11P60412 298 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 EFEMP1Q12805 493 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MFSD10Q14728 455 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NFXL1Q6ZNB6 911 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GLCCI1Q86VQ1 547 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 VSIG10LQ86VR7 867 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ZFPM1Q8IX07 1006 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ABHD17AQ96GS6 310 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SEMA6CQ9H3T2 930 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NOTCH2Q04721 2471 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CYR61O00622 381 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KRT10P13645 584 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GCGRP47871 477 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KCNA10Q16322 511 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MLANAQ16655 118 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ELOA3BQ3SY89 546 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 C8orf86Q6ZUL3 223 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ELOA3Q8NG57 546 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FOXJ1Q92949 421 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DBNDD2Q9BQY9 259 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DLL4Q9NR61 685 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 EVA1BQ9NVM1 165 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 C11orf21Q9P2W6 132 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ADGRG1Q9Y653 693 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GRXCR2A6NFK2 248 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CYSRT1A8MQ03 144 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MATN3O15232 486 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 BNIP3LO60238 219 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NUAK1O60285 661 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KRT1P04264 644 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PTGIRP43119 386 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KCNH2Q12809 1159 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 POU4F2Q12837 409 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 LBRQ14739 615 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 AGERQ15109 404 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GPR162Q16538 588 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RNF43Q68DV7 783 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FLCNQ8NFG4 579 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KCNC2Q96PR1 638 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PALD1Q9ULE6 856 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HRH3Q9Y5N1 445 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ALBP02768 609 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MS4A1P11836 297 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HRCP23327 699 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MSMPQ1L6U9 139 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ZNF792Q3KQV3 632 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ATG9BQ674R7 924 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GLIS3Q8NEA6 775 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SHKBP1Q8TBC3 707 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ZIC5Q96T25 663 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GPAMQ9HCL2 828 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NDFIP2Q9NV92 336 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PIM2Q9P1W9 311 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DDX11L8A8MPP1 907 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DHX15O43143 795 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 LILRB5O75023 590 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TMEM253P0C7T8 217 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 C6P13671 934 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GPC1P35052 558 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ACVRL1P37023 503 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PDIA6Q15084 440 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FAM161AQ3B820 660 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 C4orf48Q5BLP8 95 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 WDR44Q5JSH3 913 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 EFHC2Q5JST6 749 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NBPF14Q5TI25 921 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HHIPL2Q6UWX4 724 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SCUBE1Q8IWY4 988 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PGBD3Q8N328 593 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NBPF15Q8N660 670 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 AKTIPQ9H8T0 292 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CD320Q9NPF0 282 aa0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.2 ms