RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 SIK1P57059 783 aa28.12■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.12■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 SBF2Q86WG5 1849 aa28.11■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 STARD3NLO95772 234 aa28.11■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.11■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 ANXA1P04083 346 aa28.1■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.1■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.1■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 MS4A1P11836 297 aa28.09■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.09■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 G2E3Q7L622 706 aa28.09■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.09■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM27P14373 513 aa28.09■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 MYL6BP14649 208 aa28.09■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.09■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 BTAF1O14981 1849 aa28.08■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 PTPRCP08575 1304 aa28.08■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 FLIIQ13045 1269 aa28.08■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 HYPKQ9NX55 129 aa28.08■■■□□ 2.09
PSPC1-204ENST00000492741 PDE3AQ14432 1141 aa28.07■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 PROSER3Q2NL68 480 aa28.06■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 TNNQ9UQP3 1299 aa28.06■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 A1BGP04217 495 aa28.06■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 PANK1Q8TE04 598 aa28.06■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 PDIA6Q15084 440 aa28.05■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 ERBB4Q15303 1308 aa28.04■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.04■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 CACNA1FO60840 1977 aa28.03■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PSPC1-204ENST00000492741 ITPK1Q13572 414 aa28.01■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 RLBP1P12271 317 aa28.01■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 KCNQ4P56696 695 aa28.01■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 CRBNQ96SW2 442 aa28.01■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 EP400Q96L91 3159 aa28■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 NBPF26B4DH59 902 aa28■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 NBPF14Q5TI25 921 aa28■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 NBPF15Q8N660 670 aa28■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 COG6Q9Y2V7 657 aa28■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 APBA3O96018 575 aa27.98■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 COPS6Q7L5N1 327 aa27.98■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.98■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 F6X3S4 739 aa27.98■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.98■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.97■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.97■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.96■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.96■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 TJP1Q07157 1748 aa27.96■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.95■■■□□ 2.07
PSPC1-204ENST00000492741 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.95■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.95■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.95■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 ARXQ96QS3 562 aa27.95■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 ABCC4O15439 1325 aa27.94■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.94■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.93■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.92■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 KSR2Q6VAB6 950 aa27.92■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.92■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.92■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.92■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.91■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 PLSCR1O15162 318 aa27.91■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.91■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 LY75O60449 1722 aa27.91■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.89■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
PSPC1-204ENST00000492741 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.89■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.89■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 ADCY9O60503 1353 aa27.88■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 TXNRD1Q16881 649 aa27.88■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.88■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.87■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.87■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.85■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.85■■■□□ 2.05
PSPC1-204ENST00000492741 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.4 ms