RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 TEFQ10587 303 aa20.22■□□□□ 0.83
CHTF18-211ENST00000491530 WWC1Q8IX03 1113 aa20.22■□□□□ 0.83
CHTF18-211ENST00000491530 ITPK1Q13572 414 aa20.21■□□□□ 0.83
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF521Q96K83 1311 aa20.21■□□□□ 0.83
CHTF18-211ENST00000491530 ATG3Q9NT62 314 aa20.2■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 ATP10DQ9P241 1426 aa20.19■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 NGEFQ8N5V2 710 aa20.19■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.18■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.18■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 SLC39A6Q13433 755 aa20.18■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.17■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 KCNQ3O43525 872 aa20.17■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.17■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF853P0CG23 659 aa20.16■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 BTBD11A6QL63 1104 aa20.15■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF790Q6PG37 636 aa20.15■□□□□ 0.82
CHTF18-211ENST00000491530 CHL1O00533 1208 aa20.14■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 MMP10P09238 476 aa20.14■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 WDR63Q8IWG1 891 aa20.14■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 CFAP44Q96MT7 982 aa20.13■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.13■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 IL16Q14005 1332 aa20.12■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 IFT57Q9NWB7 429 aa20.12■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.12■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.11■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.11■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 GNAI1P63096 354 aa20.1■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 MBIPQ9NS73 344 aa20.1■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 ADCY9O60503 1353 aa20.09■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.09■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.09■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CHTF18-211ENST00000491530 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.07■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.07■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.07■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.06■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.06■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 RFC4P35249 363 aa20.06■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 GOLGA2Q08379 1002 aa20.06■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.06■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.06■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.05■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 A0A0G2JLW4 131 aa20.05■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 KRT24Q2M2I5 525 aa20.05■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 BCS1LQ9Y276 419 aa20.05■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 SCN7AQ01118 1682 aa20.04■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.04■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 RPS6KA4O75676 772 aa20.04■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 GYS1P13807 737 aa20.04■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 ADRA2BP18089 450 aa20.04■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 SLFN5Q08AF3 891 aa20.04■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.04■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 TGFB2P61812 414 aa20.03■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.03■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.03■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.03■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.02■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CHTF18-211ENST00000491530 E9PSI1 815 aa20.01■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.01■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 DPEP1P16444 411 aa20■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 C8orf58Q8NAV2 365 aa20■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 MYH16Q9H6N6 1097 aa20■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 USP16Q9Y5T5 823 aa20■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 BCORQ6W2J9 1755 aa20■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.99■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.99■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 TSPYL6Q8N831 410 aa19.99■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 HSPA6P17066 643 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.97■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 KIF3CO14782 793 aa19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 FKBP8Q14318 412 aa19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-211ENST00000491530 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90 ms