RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB33	Q86T24	672 aa		8.82	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		8.82	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNR	Q92752	1358 aa		8.82	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	TONSL	Q96HA7	1378 aa		8.82	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		8.82	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADGRB3	O60242	1522 aa		8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		8.81	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		8.8	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		8.8	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPRM	P28827	1452 aa		8.8	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	MROH2A	A6NES4	1674 aa		8.8	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	C3	P01024	1663 aa		8.79	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		8.79	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIK3CD	O00329	1044 aa		8.79	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		8.79	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		8.79	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		8.79	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		8.79	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP9B	O43861	1147 aa		8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		8.78	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		8.77	□□□□□ -1
RABGGTB-212	ENST00000491266	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESPN	B1AK53	854 aa		8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	LTK	P29376	864 aa		8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGER	Q15109	404 aa		8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPND	Q8N594	471 aa		8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFYVE9	O95405	1425 aa		8.77	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		8.76	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC19A1	P41440	591 aa		8.76	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRYD7	Q5W111	196 aa		8.76	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		8.76	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIAH2	O43255	324 aa		8.75	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	8.75	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		8.75	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDK15	Q96Q40	435 aa		8.75	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		8.75	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT7A	O00755	349 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYOM2	P54296	1465 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLRP1	Q9C000	1473 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF135	Q8IUD6	432 aa		8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	8.73	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIK3C2G	O75747	1445 aa		8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP17L5	A8MUK1	530 aa		8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	SKI	P12755	728 aa		8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC125	Q86Z20	511 aa		8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	8.72	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFT172	Q9UG01	1749 aa		8.71	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		8.71	□□□□□ -1.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP17L3	A6NCW0	530 aa		8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP17L4	A6NCW7	530 aa		8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF20	Q5VTR2	975 aa		8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		8.71	□□□□□ -1.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		8.71	□□□□□ -1.02

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