RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIK3C2GO75747 1445 aa19.55■□□□□ 0.72
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FILIP1LQ4L180 1135 aa19.55■□□□□ 0.72
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa19.53■□□□□ 0.72
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.53■□□□□ 0.72
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBX22Q9Y458 520 aa19.47■□□□□ 0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.71
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMARCE1Q969G3 411 aa19.46■□□□□ 0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC24BO95487 1268 aa19.46■□□□□ 0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa19.46■□□□□ 0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAND2P61296 217 aa19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP100Q494V2 611 aa19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTS2O95450 1211 aa19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.45■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC39A6Q13433 755 aa19.44■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPM2O94759 1503 aa19.44■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAPBQ9H115 298 aa19.44■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKAP2Q9Y2D5 859 aa19.44■□□□□ 0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.44■□□□□ 0.7
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