RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473186.5

KMT2C-208, Transcript of lysine methyltransferase 2C, human

TSL 1 (best)

Gene KMT2C, Length 12,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KMT2C-208	ENST00000473186	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	YEATS4	O95619	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	PRKAR2B	P31323	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	GSDMD	P57764	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	KDM6B	O15054	1643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	ZPR1	O75312	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	CTNNA2	P26232	953 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	MSH6	P52701	1360 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	TUBB4B	P68371	445 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC102A	Q96A19	550 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KMT2C-208	ENST00000473186	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186		A0A087WZG4	1122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	AACS	Q86V21	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NAPB	Q9H115	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PDE4B	Q07343	736 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TTC14	Q96N46	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CNGA1	P29973	690 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	KIF21B	O75037	1637 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FOSB	P53539	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC77	Q9BR77	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	WDR62	O43379	1518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ABCC11	Q96J66	1382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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