RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-209ENST00000470356 USPL1Q5W0Q7 1092 aa41.91■■■■■ 4.3
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HMG20B-209ENST00000470356 DCTN1Q14203 1278 aa41.65■■■■■ 4.26
HMG20B-209ENST00000470356 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa41.64■■■■■ 4.26
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
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HMG20B-209ENST00000470356 PLEKHF1Q96S99 279 aa41.57■■■■■ 4.25
HMG20B-209ENST00000470356 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa41.56■■■■■ 4.24
HMG20B-209ENST00000470356 DLEC1Q9Y238 1755 aa41.55■■■■■ 4.24
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HMG20B-209ENST00000470356 H0YIN7 160 aa41.5■■■■■ 4.23
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HMG20B-209ENST00000470356 NFE2L2Q16236 605 aa41.5■■■■■ 4.23
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HMG20B-209ENST00000470356 TTLL6Q8N841 843 aa41.48■■■■■ 4.23
HMG20B-209ENST00000470356 BRIP1Q9BX63 1249 aa41.48■■■■■ 4.23
HMG20B-209ENST00000470356 MIS18AQ9NYP9 233 aa41.48■■■■■ 4.23
HMG20B-209ENST00000470356 BCORQ6W2J9 1755 aa41.48■■■■■ 4.23
HMG20B-209ENST00000470356 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa41.47■■■■■ 4.23
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HMG20B-209ENST00000470356 NBPF15Q8N660 670 aa41.44■■■■■ 4.22
HMG20B-209ENST00000470356 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa41.44■■■■■ 4.22
HMG20B-209ENST00000470356 RNF181Q9P0P0 153 aa41.43■■■■■ 4.22
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HMG20B-209ENST00000470356 KDM3BQ7LBC6 1761 aa41.41■■■■■ 4.22
HMG20B-209ENST00000470356 CNBD1Q8NA66 436 aa41.4■■■■■ 4.22
HMG20B-209ENST00000470356 CCDC24Q8N4L8 307 aa41.39■■■■■ 4.22
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF652Q9Y2D9 606 aa41.39■■■■■ 4.22
HMG20B-209ENST00000470356 CEP350Q5VT06 3117 aa41.38■■■■■ 4.22
HMG20B-209ENST00000470356 RGL2O15211 777 aa41.38■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 LAMB4A4D0S4 1761 aa41.37■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 NPHP1O15259 732 aa41.36■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 NMRK2Q9NPI5 230 aa41.36■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 HSPA6P17066 643 aa41.35■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP41.35■■■■■ 4.215e-9■□□□□ 10
HMG20B-209ENST00000470356 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 ST5P78524 1137 aa41.34■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 RASSF7Q02833 373 aa41.34■■■■■ 4.21
HMG20B-209ENST00000470356 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
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