RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.08■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.08■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM4SF1P30408 202 aa35.07■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NARFQ9UHQ1 456 aa35.07■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STARD3NLO95772 234 aa35.06■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF790Q6PG37 636 aa35.06■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCHSD2O94868 740 aa35.05■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CANXP27824 592 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNA3P22001 575 aa35.03■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa35.02■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEG1Q9ULI3 1381 aa35.02■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIM2Q9P1W9 311 aa35.02■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa35.01■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFIXQ14938 502 aa34.99■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMNL2Q96PY5 1086 aa34.98■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL2L12Q9HB09 334 aa34.98■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF5P55010 431 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087WZG4 1122 aa34.96■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTBD11A6QL63 1104 aa34.96■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNA5P30532 468 aa34.96■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa34.95■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB2P05120 415 aa34.92■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNQ3O43525 872 aa34.91■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRXN2Q9P2S2 1712 aa34.91■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM10Q7L590 875 aa34.9■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A1BGP04217 495 aa34.87■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BICDL1Q6ZP65 573 aa34.87■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa34.86■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCTN1Q14203 1278 aa34.84■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCN7AQ01118 1682 aa34.84■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf131Q5VYM1 1079 aa34.83■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D9BQ66K14 1250 aa34.83■■■■□ 3.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF3CO14782 793 aa34.82■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEFMP07197 916 aa34.81■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP16Q9Y5T5 823 aa34.81■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARMIL3Q8ND23 1372 aa34.79■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2CD5Q86YS7 1000 aa34.79■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.78■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa34.77■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0YIN7 160 aa34.77■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMTA2O94983 1202 aa34.76■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL6Q8N841 843 aa34.76■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF181Q9P0P0 153 aa34.76■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP350Q5VT06 3117 aa34.74■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SETDB2Q96T68 719 aa34.74■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR5LQ6MZQ0 368 aa34.73■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPA6P17066 643 aa34.72■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.72■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCORQ6W2J9 1755 aa34.72■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE6BP35913 854 aa34.71■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHF1Q96S99 279 aa34.71■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NMRK2Q9NPI5 230 aa34.71■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa34.71■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.7■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIS18AQ9NYP9 233 aa34.7■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLG5Q8TDM6 1919 aa34.7■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SBF1O95248 1867 aa34.69■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC24Q8N4L8 307 aa34.69■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPHP1O15259 732 aa34.68■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASSF7Q02833 373 aa34.68■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFE2L2Q16236 605 aa34.68■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNBD1Q8NA66 436 aa34.68■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOMM70O94826 608 aa34.67■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP34.67■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.66■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC4GQ6UXB4 293 aa34.66■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF652Q9Y2D9 606 aa34.66■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa34.65■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF26B4DH59 902 aa34.65■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF15Q8N660 670 aa34.65■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST5P78524 1137 aa34.64■■■■□ 3.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMNB1P20700 586 aa34.63■■■■□ 3.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RALBP1Q15311 655 aa34.63■■■■□ 3.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM3BQ7LBC6 1761 aa34.62■■■■□ 3.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMB4A4D0S4 1761 aa34.61■■■■□ 3.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
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