RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 MCM10Q7L590 875 aa27.9■■■□□ 2.06
LTB-211ENST00000446745 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
LTB-211ENST00000446745 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
LTB-211ENST00000446745 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.89■■■□□ 2.06
LTB-211ENST00000446745 A0A087WZG4 1122 aa27.88■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.87■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 TGFB2P61812 414 aa27.86■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 FKBP8Q14318 412 aa27.86■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 NARFQ9UHQ1 456 aa27.86■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.85■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.85■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.85■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 NFE2L2Q16236 605 aa27.84■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.84■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 DCTN1Q14203 1278 aa27.83■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
LTB-211ENST00000446745 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 KCNQ3O43525 872 aa27.8■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.8■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 TM4SF1P30408 202 aa27.78■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 DDR1Q08345 913 aa27.78■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
LTB-211ENST00000446745 A0A0G2JLW4 131 aa27.75■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 A1BGP04217 495 aa27.75■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.75■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.75■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 NFIXQ14938 502 aa27.74■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.74■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 DPEP1P16444 411 aa27.73■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 USP16Q9Y5T5 823 aa27.73■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 SCN7AQ01118 1682 aa27.72■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.71■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 RIPK4P57078 832 aa27.71■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.71■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.71■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 BCS1LQ9Y276 419 aa27.71■■■□□ 2.03
LTB-211ENST00000446745 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.7■■■□□ 2.02
LTB-211ENST00000446745 PIM2Q9P1W9 311 aa27.7■■■□□ 2.02
LTB-211ENST00000446745 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
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LTB-211ENST00000446745 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.68■■■□□ 2.02
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LTB-211ENST00000446745 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
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LTB-211ENST00000446745 BCORQ6W2J9 1755 aa27.64■■■□□ 2.02
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LTB-211ENST00000446745 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
LTB-211ENST00000446745 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.64■■■□□ 2.02
LTB-211ENST00000446745 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.64■■■□□ 2.02
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LTB-211ENST00000446745 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.64■■■□□ 2.02
LTB-211ENST00000446745 NPHP1O15259 732 aa27.63■■■□□ 2.01
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LTB-211ENST00000446745 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.61■■■□□ 2.01
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LTB-211ENST00000446745 CNBD1Q8NA66 436 aa27.58■■■□□ 2.01
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LTB-211ENST00000446745 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 PDE6BP35913 854 aa27.57■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 ST5P78524 1137 aa27.57■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.57■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.56■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.56■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 ERBB4Q15303 1308 aa27.56■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 ADCY9O60503 1353 aa27.56■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.55■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.54■■■□□ 2
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