RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 TEFQ10587 303 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 ZPR1O75312 459 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 KCNA3P22001 575 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 KCNQ3O43525 872 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 TM4SF1P30408 202 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF790Q6PG37 636 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 FCHSD2O94868 740 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 NARFQ9UHQ1 456 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 CHRNA5P30532 468 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 NFIXQ14938 502 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 NUDCQ9Y266 331 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-208ENST00000392449 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 MCM10Q7L590 875 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 STARD3NLO95772 234 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 DCTN1Q14203 1278 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 BTBD11A6QL63 1104 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 PIM2Q9P1W9 311 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 A1BGP04217 495 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 SCN7AQ01118 1682 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-208ENST00000392449 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 CEP350Q5VT06 3117 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 SERPINB2P05120 415 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 USP16Q9Y5T5 823 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 A0A087WZG4 1122 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 POTEDQ86YR6 584 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 KIF3CO14782 793 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 BCORQ6W2J9 1755 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRK-208ENST00000392449 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 SBF1O95248 1867 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 CAMTA2O94983 1202 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 RASSF7Q02833 373 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTPRK-208ENST00000392449 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 RNF181Q9P0P0 153 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 NBPF26B4DH59 902 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 NBPF15Q8N660 670 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-208ENST00000392449 H0YIN7 160 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 PRELPP51888 382 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 TTLL6Q8N841 843 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 NFE2L2Q16236 605 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 SETDB2Q96T68 719 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 CACNA1SQ13698 1873 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 NEFMP07197 916 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 CNBD1Q8NA66 436 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 HSPA6P17066 643 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 NPHP1O15259 732 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 NFKBIEO00221 500 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRK-208ENST00000392449 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRK-208ENST00000392449 PDE6BP35913 854 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRK-208ENST00000392449 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRK-208ENST00000392449 NGEFQ8N5V2 710 aa21.94■■□□□ 1.1
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