RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382940.8

NME4-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NME4, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-202ENST00000382940 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.26e-11■□□□□ 10
NME4-202ENST00000382940 FKBP8Q14318 412 aa28.77■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.77■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.76■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.76■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 C4AP0C0L4 1744 aa28.76■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 KCNQ3O43525 872 aa28.75■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 NFE2L2Q16236 605 aa28.75■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 NARFQ9UHQ1 456 aa28.74■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.74■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 A0A087WZG4 1122 aa28.73■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 UTRNP46939 3433 aa28.73■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 TGFB2P61812 414 aa28.71■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.7■■■□□ 2.19
NME4-202ENST00000382940 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 DDR1Q08345 913 aa28.68■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 A1BGP04217 495 aa28.67■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 A0A0G2JLW4 131 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 TM4SF1P30408 202 aa28.65■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 USP16Q9Y5T5 823 aa28.65■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 RIPK4P57078 832 aa28.64■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 NFIXQ14938 502 aa28.64■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
NME4-202ENST00000382940 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.63■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 DPEP1P16444 411 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 BCS1LQ9Y276 419 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 CHD4Q14839 1912 aa28.6■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 SERPINB2P05120 415 aa28.58■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
NME4-202ENST00000382940 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.57■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 NEUROD2Q15784 382 aa28.57■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 RUNDC1Q96C34 613 aa28.57■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 PIM2Q9P1W9 311 aa28.56■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.56■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.55■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.55■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.55■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 NPHP1O15259 732 aa28.54■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 CAMTA2O94983 1202 aa28.53■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 CHRNA5P30532 468 aa28.53■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 SETDB2Q96T68 719 aa28.53■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.53■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.52■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
NME4-202ENST00000382940 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 KCNA3P22001 575 aa28.51■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.5■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 NBPF26B4DH59 902 aa28.5■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 NBPF15Q8N660 670 aa28.5■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 SCN7AQ01118 1682 aa28.5■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.49■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.48■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.47■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.47■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 NGEFQ8N5V2 710 aa28.46■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 CNBD1Q8NA66 436 aa28.46■■■□□ 2.15
NME4-202ENST00000382940 H0YIN7 160 aa28.45■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.45■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 ST5P78524 1137 aa28.44■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.44■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 ATP10DQ9P241 1426 aa28.43■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 MYL6BP14649 208 aa28.43■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 PDE6BP35913 854 aa28.43■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.43■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.42■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.42■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.42■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.42■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 RGL2O15211 777 aa28.41■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.41■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.41■■■□□ 2.14
NME4-202ENST00000382940 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
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